RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 BACH2Q9BYV9 841 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXA4-201ENST00000360046 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 CDC45O75419 566 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 GPSM2P81274 684 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC102BQ68D86 513 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 PHKA1P46020 1223 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 TTLL6Q8N841 843 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 KCNA3P22001 575 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 OLFM4Q6UX06 510 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 HAUS7Q99871 368 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 SLX4Q8IY92 1834 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 PIM2Q9P1W9 311 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 EVI5LQ96CN4 794 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 UFL1O94874 794 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 GYG1P46976 350 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 BCAMP50895 628 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 GGA1Q9UJY5 639 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 KLRK1P26718 216 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 CASC1Q6TDU7 716 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 VPS37DQ86XT2 251 aa26.59■■□□□ 1.85
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HOXA4-201ENST00000360046 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 SCARF1Q14162 830 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 SNRKQ9NRH2 765 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 LTBP1Q14766 1721 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXA4-201ENST00000360046 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 MPNDQ8N594 471 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 PAG1Q9NWQ8 432 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 GOLIM4O00461 696 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 C21orf2O43822 256 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 MCAMP43121 646 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 FSD1Q9BTV5 496 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 PI16Q6UXB8 463 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 C6orf229H3BNL8 230 aa26.55■■□□□ 1.84
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HOXA4-201ENST00000360046 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
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HOXA4-201ENST00000360046 ZAP70P43403 619 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 POLLQ9UGP5 575 aa26.54■■□□□ 1.84
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HOXA4-201ENST00000360046 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 CHMLP26374 656 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 SPATA5Q8NB90 893 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXA4-201ENST00000360046 SEC24BO95487 1268 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 BCS1LQ9Y276 419 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 MED23Q9ULK4 1368 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC93Q567U6 631 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 RIMBP2O15034 1052 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 HIP1O00291 1037 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 SYT17Q9BSW7 474 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 SEMA3EO15041 775 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 RFX7Q2KHR2 1363 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 SOGA3Q5TF21 947 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
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HOXA4-201ENST00000360046 EYA3Q99504 573 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXA4-201ENST00000360046 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.46■■□□□ 1.83
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