RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.39■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 FBXW7Q969H0 707 aa21.39■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.39■■□□□ 1.02
LRRC25-201ENST00000339007 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 LAMA4Q16363 1823 aa21.39■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 MYD88Q99836 296 aa21.39■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 L2HGDHQ9H9P8 463 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 ADALQ6DHV7 355 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 A0A1W2PQ27 194 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 A0A1W2PQ64 194 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 A0A1W2PQD8 194 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 MYL6BP14649 208 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 GUCY1B3Q02153 619 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 NRDCO43847 1150 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 KCNJ6P48051 423 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 A0A1B0GVL5 298 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 SMC2O95347 1197 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 ABCC6O95255 1503 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 TUBB4AP04350 444 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 COPS6Q7L5N1 327 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 NDUFA8P51970 172 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 TMC6Q7Z403 805 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 IFNKQ9P0W0 207 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 PALLDQ8WX93 1383 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC66A2RUB6 948 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 TPM4P67936 248 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 FAM193AP78312 1265 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 PSME1Q06323 249 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 E7EWF7 191 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 NPHP1O15259 732 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 PPFIA3O75145 1194 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF790Q6PG37 636 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 STK38Q15208 465 aa21.33■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.33■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.33■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.33■■□□□ 1.01
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC93Q567U6 631 aa21.33■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.33■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.33■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.32■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.31■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.31■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 GOLIM4O00461 696 aa21.31■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 SLC39A6Q13433 755 aa21.31■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.31■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 TICAM2Q86XR7 235 aa21.31■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.31■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 YEATS4O95619 227 aa21.3■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.3■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.3■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 NEDD4P46934 1319 aa21.3■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 C5P01031 1676 aa21.3■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 NLRP12P59046 1061 aa21.3■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.3■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 CCP110O43303 1012 aa21.29■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 GCP02774 474 aa21.29■■□□□ 1
LRRC25-201ENST00000339007 CHST3Q7LGC8 479 aa21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms