RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 LMNB1P20700 586 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 POLLQ9UGP5 575 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 LTBP3Q9NS15 1303 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TMC4Q7Z404 712 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 MPHOSPH8Q99549 860 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 NUCB2P80303 420 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL40Q2TBA0 621 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMD1Q99460 953 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 COL4A5P29400 1685 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAP23O00161 211 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 GNAI2P04899 355 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 LTBP1Q14766 1721 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 YY1P25490 414 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC173Q0VFZ6 552 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC24Q50LG9 513 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF7LQ5H9L4 462 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF5LO75529 589 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 AOC3Q16853 763 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D16Q8TBP0 767 aa31.79■■■□□ 2.68
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CAPNS1-201ENST00000246533 TTC22Q5TAA0 569 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CASC1Q6TDU7 716 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf229H3BNL8 230 aa31.77■■■□□ 2.68
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CAPNS1-201ENST00000246533 CNNM1Q9NRU3 951 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-201ENST00000246533 PODXL2Q9NZ53 605 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-201ENST00000246533 RIMBP2O15034 1052 aa31.75■■■□□ 2.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-201ENST00000246533 XDHP47989 1333 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIP5K2O43314 1243 aa31.74■■■□□ 2.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 GGA1Q9UJY5 639 aa31.73■■■□□ 2.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 YDJCA8MPS7 323 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TPM2P07951 284 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL24Q5JXM2 366 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-201ENST00000246533 VGLL2Q8N8G2 317 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXD4L1Q9NU39 408 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-201ENST00000246533 FZD9O00144 591 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 POLA2Q14181 598 aa31.63■■■□□ 2.65
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