RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCC6O95255 1503 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 FEZ1Q99689 392 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 ANO10Q9NW15 660 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.94■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.93■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 KINO60870 393 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 E7EWF7 191 aa25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXO4P98177 505 aa25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXL16Q8N461 479 aa25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLIM4O00461 696 aa25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 MEGF6O75095 1541 aa25.91■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 BECN2A8MW95 431 aa25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 H7C1W4 665 aa25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 DCAF5Q96JK2 942 aa25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 CEP135Q66GS9 1140 aa25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 KCND1Q9NSA2 647 aa25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.9■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 EVCP57679 992 aa25.89■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 NYAP1Q6ZVC0 841 aa25.89■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 FSIP1Q8NA03 581 aa25.89■■□□□ 1.74
HTATSF1-201ENST00000218364 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 FOSBP53539 338 aa25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 ARID5BQ14865 1188 aa25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 CEP57L1Q8IYX8 460 aa25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.88■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 SKILP12757 684 aa25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 ME1P48163 572 aa25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 CCZ1BP86790 482 aa25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 MAST3O60307 1309 aa25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1W2PQ27 194 aa25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1W2PQ64 194 aa25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1W2PQD8 194 aa25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF1AQ12756 1690 aa25.87■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 GLI3P10071 1580 aa25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A0G2JLW4 131 aa25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 ADALQ6DHV7 355 aa25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC69A6NI79 296 aa25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 OGFRQ9NZT2 677 aa25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.86■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 USP27XA6NNY8 438 aa25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 SPEF2Q9C093 1822 aa25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 TIMM10P62072 90 aa25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 ALS2Q96Q42 1657 aa25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP27B1O15528 508 aa25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPN14Q15678 1187 aa25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 GUCY1B3Q02153 619 aa25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 GSDMDP57764 484 aa25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 BPIFA3Q9BQP9 254 aa25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1-201ENST00000218364 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1-201ENST00000218364 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1-201ENST00000218364 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1-201ENST00000218364 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A087WWV3 80 aa25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1-201ENST00000218364 EYA2O00167 538 aa25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1-201ENST00000218364 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1-201ENST00000218364 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms