RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC25A19Q9HC21 320 aa24.26■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa24.25■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 CFL1P23528 166 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM3AP98173 230 aa24.25■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 OR8B8Q15620 311 aa24.25■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC35D3Q5M8T2 416 aa24.25■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 DCDC5Q6ZRR9 648 aa24.25■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 CLN8Q9UBY8 286 aa24.25■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 FSTL3O95633 263 aa24.24■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 CD80P33681 288 aa24.24■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 CRISP1P54107 249 aa24.24■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 HILS1P60008 231 aa24.24■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 APOFQ13790 326 aa24.24■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 LYPD2Q6UXB3 125 aa24.24■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 USP43Q70EL4 1123 aa24.24■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 RHOUQ7L0Q8 258 aa24.24■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 PLPP7Q8NBV4 271 aa24.24■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 LAMP5Q9UJQ1 280 aa24.24■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 C3orf80F5H4A9 247 aa24.23■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 TRIM77I1YAP6 450 aa24.23■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP5HO75947 161 aa24.23■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 GNALP38405 381 aa24.23■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 KCNJ8Q15842 424 aa24.23■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 OR5K1Q8NHB7 308 aa24.23■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 ZFAND2BQ8WV99 257 aa24.23■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 HAX1O00165 279 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 FSHBP01225 129 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 GSK3AP49840 483 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 ACTG1P63261 375 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 C1orf146Q5VVC0 180 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 FAHD1Q6P587 224 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRN1Q6UXK5 716 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF826PQ6ZT77 177 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 KRT77Q7Z794 578 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 RAB40AQ8WXH6 277 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 NUP50Q9UKX7 468 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa24.22■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 LGALS8O00214 317 aa24.21■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 DAPP51397 102 aa24.21■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 PRSS45Q7RTY3 260 aa24.21■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 TECTBQ96PL2 329 aa24.21■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 PRRG3Q9BZD7 231 aa24.21■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 RGCCQ9H4X1 137 aa24.21■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 KRT84Q9NSB2 600 aa24.21■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF319Q9P2F9 582 aa24.21■■□□□ 1.47
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 G3V2T6 193 aa24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 HCCSP53701 268 aa24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP6AP1Q15904 470 aa24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 LCN1P1Q5VSP4 162 aa24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 FTMTQ8N4E7 242 aa24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 TRIM36Q9NQ86 728 aa24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 FBN3Q75N90 2809 aa24.2■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC2A5P22732 501 aa24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 FASP25445 335 aa24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 PAX8Q06710 450 aa24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 SNCBQ16143 134 aa24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 C12orf54Q6X4T0 127 aa24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 PARP8Q8N3A8 854 aa24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 NIPAL2Q9H841 368 aa24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ERVK-18Q9QC07 812 aa24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 AP4S1Q9Y587 144 aa24.19■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 OOEPA6NGQ2 149 aa24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 PHYHO14832 338 aa24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ADAM20O43506 726 aa24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ALOX5APP20292 161 aa24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ESRRGP62508 458 aa24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 TEAD3Q99594 435 aa24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 YIPF3Q9GZM5 350 aa24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF69Q9UC07 566 aa24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 LRP12Q9Y561 859 aa24.18■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ANXA2P2A6NMY6 339 aa24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 MITFO75030 526 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 PAX2Q02962 417 aa24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 MICU1Q9BPX6 476 aa24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa24.16■■□□□ 1.46
SEMA3B-215ENST00000621029 PSMD9O00233 223 aa24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms