RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 ST8SIA4Q92187 359 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 SLAMF6Q96DU3 332 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 CENPMQ9NSP4 180 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 IL20Q9NYY1 176 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 XRCC2O43543 280 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 SPARCP09486 303 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 TAF13Q15543 124 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 WDR86Q86TI4 376 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 PDZD9Q8IXQ8 264 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 SLC37A3Q8NCC5 494 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 CD300AQ9UGN4 299 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0G2JK05 382 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTPRF-216ENST00000617451 GRK5P34947 590 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 ENTPD1P49961 510 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTPRF-216ENST00000617451 TEX30Q5JUR7 227 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 VMO1Q7Z5L0 202 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 FGFRL1Q8N441 504 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 LY6G5BQ8NDX9 201 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 OR8S1Q8NH09 359 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 DPAGT1Q9H3H5 408 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GW55 424 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 ARPC2O15144 300 aa20.52■□□□□ 0.88
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PTPRF-216ENST00000617451 DUX4L6P0CJ89 424 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 DUX4L7P0CJ90 424 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 FMO3P31513 532 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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PTPRF-216ENST00000617451 TAF9Q16594 264 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 SLC16A9Q7RTY1 509 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF511Q8NB15 262 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 OR9Q2Q8NGE9 314 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 OR8D4Q8NGM9 314 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC29Q8WV35 223 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 CCL13Q99616 98 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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PTPRF-216ENST00000617451 DUX4Q9UBX2 424 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 FAM96BQ9Y3D0 163 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF878C9JN71 531 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 WDR38Q5JTN6 314 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 DPY19L4Q7Z388 723 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 OR1M1Q8NGA1 313 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 LRTOMTQ8WZ04 291 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 UBE2FQ969M7 185 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 DMRTB1Q96MA1 342 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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PTPRF-216ENST00000617451 CRMP1Q14194 572 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 WDR82Q6UXN9 313 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZSV7 163 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 LINC00471Q8N535 108 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 NPRL2Q8WTW4 380 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 SGK3Q96BR1 496 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 TCF7L1Q9HCS4 588 aa20.5■□□□□ 0.87
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PTPRF-216ENST00000617451 SPI1P17947 270 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 SLC15A1P46059 708 aa20.49■□□□□ 0.87
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PTPRF-216ENST00000617451 GRB2P62993 217 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 CSNK2BP67870 215 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 TIGD6Q17RP2 521 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 FAM216BQ8N7L0 139 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 REEP6Q96HR9 211 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 C16orf95Q9H693 158 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 TNFRSF11BO00300 401 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 GPR37O15354 613 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 TIPRLO75663 272 aa20.48■□□□□ 0.87
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