RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC3-209ENST00000616395 OPN4Q9UHM6 478 aa14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A1W2PPW3 197 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SELENOFO60613 162 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 RP2O75695 350 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SULT1C4O75897 302 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF432O94892 652 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CBR1P16152 277 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CELP19835 753 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ENTPD1P49961 510 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF84P51523 738 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDONQ4KMG0 1287 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SYT14Q8NB59 555 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 THEM6Q8WUY1 208 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 THRSPQ92748 146 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TXNDC15Q96J42 360 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR2M2Q96R28 347 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 NOX3Q9HBY0 568 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 GNG8Q9UK08 70 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 RCE1Q9Y256 329 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 METTL15A6NJ78 407 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC43A1O75387 559 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ALDH3B1P43353 468 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CSNK1A1P48729 337 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 EVX1P49640 407 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 VBP1P61758 197 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF85Q03923 595 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 DOK3Q7L591 496 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TIGD4Q8IY51 512 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM123Q8N131 208 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF511Q8NB15 262 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TSSK2Q96PF2 358 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CRLF2Q9HC73 371 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 NCR1O76036 304 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CD1AP06126 327 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPARCP09486 303 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 NR4A1P22736 598 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TEX30Q5JUR7 227 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 AVPI1Q5T686 147 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 OTOSQ8NHW6 89 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 KCTD7Q96MP8 289 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SYT3Q9BQG1 590 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 MROQ9BYG7 248 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR51E2Q9H255 320 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A1W2PPL8 197 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TVP23AA6NH52 213 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF254O75437 659 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 PGA4P0DJD7 388 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 PGA3P0DJD8 388 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CTLA4P16410 223 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 LAP3P28838 519 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 GCH1P30793 250 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TGM4P49221 684 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 LSAMPQ13449 338 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CAMK2DQ13557 499 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SSX1Q16384 188 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 KRT77Q7Z794 578 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARR3P36575 388 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR12D2P58182 307 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPCS2Q15005 226 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CEACAM16Q2WEN9 425 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TP53I3Q53FA7 332 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms