RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 MED22Q15528 200 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM57BQ71RH2 274 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ELMOD2Q8IZ81 293 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF101Q8IZC7 436 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 G6PC2Q9NQR9 355 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 POU2F3Q9UKI9 436 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 SHISA9B4DS77 424 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 OGG1O15527 345 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 CD1AP06126 327 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM157BP0CG42 384 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 PCMT1P22061 227 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP2K4P45985 399 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE2UQ5VVX9 321 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC54Q8NEL0 328 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 OR1J1Q8NGS3 322 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 RPS4Y2Q8TD47 263 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP23Q9Y6H3 246 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM212A6NML5 194 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC2A1P11166 492 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMB10P40306 273 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR50Q13585 617 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CDK5R1Q15078 307 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SNAI3Q3KNW1 292 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR38Q5JTN6 314 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CYB5R2Q6BCY4 276 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 NAA40Q86UY6 237 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 OR8B12Q8NGG6 310 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SPSB4Q96A44 273 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 OR5M11Q96RB7 305 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 BRD7Q9NPI1 651 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 STARD10Q9Y365 291 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 TBX1O43435 398 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SSX4O60224 188 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 LMX1BO60663 402 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 NGFP01138 241 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 LCKP06239 509 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CFPP27918 469 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 TIGD6Q17RP2 521 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF718Q3SXZ3 478 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM244Q5VVB8 128 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXW12Q6X9E4 464 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 KBTBD8Q8NFY9 601 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SMIM19Q96E16 107 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 COMMD4Q9H0A8 199 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CA10Q9NS85 328 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 FRRS1LQ9P0K9 344 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 OR4C45A6NMZ5 311 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 E9PI62 339 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 IGLV3-1P01715 115 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 TTRP02766 147 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ISG15P05161 165 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP6V1B1P15313 513 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 PRSS35Q8N3Z0 413 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC25A40Q8TBP6 338 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 MGLLQ99685 303 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CMAHPQ9Y471 501 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 DYSFO75923 2080 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 PLPP2O43688 288 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 LALBAP00709 142 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 RAC2P15153 192 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF250P15622 560 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SELEP16581 610 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF12P17014 697 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 GCH1P30793 250 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 KIR3DL2P43630 455 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 DSCR9P59020 149 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SELENOVP59797 346 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 GLYATL3Q5SZD4 288 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 C12orf54Q6X4T0 127 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 UFD1Q92890 307 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SGK3Q96BR1 496 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 REEP6Q96HR9 211 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 OR51B6Q9H340 312 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SMIM18P0DKX4 95 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 ACHEP22303 614 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 CCL1P22362 96 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 TPBGQ13641 420 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-214ENST00000592483 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.8 ms