RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 LRTOMTQ8WZ04 291 aa21.09■□□□□ 0.97
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CAPNS1-211ENST00000590874 COPS4Q9BT78 406 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.09■□□□□ 0.97
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNRD1Q9P1U0 126 aa21.09■□□□□ 0.97
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR1M1Q8NGA1 313 aa21.05■□□□□ 0.96
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CAPNS1-211ENST00000590874 NPRL2Q8WTW4 380 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
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CAPNS1-211ENST00000590874 TAF13Q15543 124 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa21.03■□□□□ 0.96
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC37A3Q8NCC5 494 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH10Q9Y6N8 788 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF878C9JN71 531 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 TBX1O43435 398 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 GMNNO75496 209 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CSF1P09603 554 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 SELLP14151 372 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 TGFBR2P37173 567 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 ENTPD1P49961 510 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 GUCA2AQ02747 115 aa21.02■□□□□ 0.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CMTM4Q8IZR5 234 aa21.02■□□□□ 0.96
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