RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR52I2Q8NH67 350 aa24.77■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNK15Q9H427 330 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF121Q9H920 327 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 NPAP1Q9NZP6 1156 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-210ENST00000574322 WISP2O76076 250 aa24.76■■□□□ 1.55
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CTDNEP1-210ENST00000574322 OR14I1A6ND48 311 aa24.75■■□□□ 1.55
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IL18BPO95998 194 aa24.73■■□□□ 1.55
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CTDNEP1-210ENST00000574322 OR1K1Q8NGR3 316 aa24.73■■□□□ 1.55
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SPSB4Q96A44 273 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1-210ENST00000574322 C12orf49Q9H741 205 aa24.73■■□□□ 1.55
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM53Q6P2H8 277 aa24.71■■□□□ 1.55
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CRIP3Q6Q6R5 217 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 TFAP2EQ6VUC0 442 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2AE1Q8NHA4 323 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 ITFG2Q969R8 447 aa24.7■■□□□ 1.54
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