RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED21Q13503 144 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 COMMD2Q86X83 199 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF540Q8NDQ6 660 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBASH3BQ8TF42 649 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 PELI1Q96FA3 418 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 EGLN1Q9GZT9 426 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR84Q9NQS5 396 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC22A13Q9Y226 551 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMB10P40306 273 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 ETV1P50549 477 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 FTMTQ8N4E7 242 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q96MF0 132 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q9H521 79 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 FKBP14Q9NWM8 211 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCN3BQ9NY72 215 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 MVKQ03426 396 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR38Q5JTN6 314 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 FDX2Q6P4F2 183 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 STX19Q8N4C7 294 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10AD1Q8NGE0 317 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOX7Q9BT81 388 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL19Q9UHD0 177 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 MLNRO43193 412 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC159P0C7I6 412 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6V1B1P15313 513 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF786Q8N393 782 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS35Q8N3Z0 413 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2G2Q8NGZ5 317 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-DPB1P04440 258 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 HTR1AP08908 422 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CA6P23280 308 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDLIM4P50479 330 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM168AQ92567 244 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 RDH5Q92781 318 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 H0YL77 283 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACKR3P25106 362 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP2K3P46734 347 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL36Q8N4N3 616 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 FRRS1LQ9P0K9 344 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 GMDSO60547 372 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFRSF1AP19438 455 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8G1Q15617 311 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLPP7Q8NBV4 271 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2V2Q96R30 315 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPRKBQ9Y3C4 175 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFS8O00217 210 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 P2RY10O00398 339 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 DENRO43583 198 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHRS3O75911 302 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYBB2P43320 205 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR3DL2P43630 455 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCR9P51686 369 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLBQ86Z14 1044 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC2DQ9UHP7 191 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTGES3LE9PB15 166 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACHEP22303 614 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCL1P22362 96 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CARTPTQ16568 116 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ODF4Q2M2E3 257 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2G6Q5TZ20 316 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 DOK3Q7L591 496 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52N1Q8NH53 320 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 C10orf105Q8TEF2 133 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYDGFQ969H8 173 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLL4Q9NR61 685 aa28.08■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GTI1 187 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYNX1G3V0Z9 82 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYNX1P0DP58 116 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL8A2P25067 703 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRP9P49458 86 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITLN1Q8WWA0 313 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHODLQ9H9P2 273 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms