RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 Q8TCH9 128 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ERGIC1Q969X5 290 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 RNF7Q9UBF6 113 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 MIOXQ9UGB7 285 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 C3orf80F5H4A9 247 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ALOX5APP20292 161 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 GSK3AP49840 483 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR8B8Q15620 311 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 KRT77Q7Z794 578 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR8B2Q96RD0 313 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 TEAD3Q99594 435 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC6A7Q99884 636 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRP12Q9Y561 859 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 AUP1Q9Y679 476 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 DNHD1Q96M86 4753 aa14.87□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.035e-8■□□□□ 9.7
CTDNEP1-207ENST00000572043 A8MXK9 166 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF12P17014 697 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 GNALP38405 381 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDOSTP39656 456 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ESRRGP62508 458 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SCGB2A2Q13296 93 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPERTQ8NA61 448 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 MRI1Q9BV20 369 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 C14orf119Q9NWQ9 140 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 COPS3Q9UNS2 423 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 DYSFO75923 2080 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 FCGR1AP12314 374 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PITPNBP48739 271 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 MZT1Q08AG7 82 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 POU4F2Q12837 409 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 WDR86Q86TI4 376 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 LYZL4Q96KX0 146 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 CIB1Q99828 191 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZAR1LA6NP61 321 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRR32B1ATL7 298 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 LGALS8O00214 317 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 EGR1P18146 543 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ACKR3P25106 362 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 CSNK2BP67870 215 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 C12orf73Q69YU5 71 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 TECTBQ96PL2 329 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGCCQ9H4X1 137 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLN8Q9UBY8 286 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 GYPAP02724 150 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 GMFBP60983 142 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 ASRGL1Q7L266 308 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 COMMD2Q86X83 199 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms