RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559898.5

HDDC3-205, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,024 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-205ENST00000559898 REEP6Q96HR9 211 aa14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3-205ENST00000559898 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3-205ENST00000559898 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-205ENST00000559898 E2F6O75461 281 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-205ENST00000559898 LYNP07948 512 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-205ENST00000559898 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-205ENST00000559898 SELLP14151 372 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-205ENST00000559898 MMP9P14780 707 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-205ENST00000559898 SLC15A1P46059 708 aa14.69□□□□□ -0.06
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