RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	CMAHP	Q9Y471	501 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	CACNG2	Q9Y698	323 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222		J3QW42	95 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222		M0R135	149 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	PHYH	O14832	338 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	H2BFM	P0C1H6	154 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	MYF6	P23409	242 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	MAGEB1	P43366	347 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	CXCR4	P61073	352 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ERVS71-1	P61550	626 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	PPP1CB	P62140	327 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	RAB40B	Q12829	278 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	TAF13	Q15543	124 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	DRAM2	Q6UX65	266 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	NAA40	Q86UY6	237 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ABHD4	Q8TB40	342 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ZNF799	Q96GE5	643 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	OR8B4	Q96RC9	309 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	STARD10	Q9Y365	291 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CS-231	ENST00000552222	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	VSTM5	A8MXK1	200 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	ZNF254	O75437	659 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	LCK	P06239	509 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	ZNF250	P15622	560 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	TUBG1	P23258	451 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	HSD11B1	P28845	292 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	PRKX	P51817	358 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	LCN2	P80188	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	BAMBI	Q13145	260 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	KLHL22	Q53GT1	634 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	SSX6	Q7RTT6	188 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	KRT77	Q7Z794	578 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	RDH5	Q92781	318 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	COG8	Q96MW5	612 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	TBX5	Q99593	518 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	NIPAL2	Q9H841	368 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	LRP12	Q9Y561	859 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222		A0A0G2JMP0	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222		A0A0X1KG70	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222		H3BSA7	217 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	PSMD9	O00233	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	IGHA1	P01876	353 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	APOC1	P02654	83 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	LCAT	P04180	440 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	ACHE	P22303	614 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	DCTD	P32321	178 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	SLC6A9	P48067	706 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	CX3CR1	P49238	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	EVX1	P49640	407 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	ACTC1	P68032	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	ACTA1	P68133	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	ZNF85	Q03923	595 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	EGR3	Q06889	387 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	MRO	Q9BYG7	248 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	POFUT1	Q9H488	388 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222	C5orf63	A6NC05	138 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CS-231	ENST00000552222		M0R233	179 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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