RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ABHD1Q96SE0 405 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR51I1Q9H343 314 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf42Q9NWW7 574 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ASB1Q9Y576 335 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0U1RQV5 110 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 H7C1C5 153 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OGG1O15527 345 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NCR1O76036 304 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 RNFT1Q5M7Z0 435 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SULF2Q8IWU5 870 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 TVP23CQ96ET8 276 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 OR2A25A4D2G3 310 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 IL3RAP26951 378 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SSTR4P31391 388 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TDGF1P3P51864 188 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 KRTDAPP60985 99 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR2T5Q6IEZ7 315 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 OR2T29Q8NH02 315 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO27Q8NI29 283 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR2A14Q96R47 310 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TBX15Q96SF7 602 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FEZF1A0PJY2 475 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 GAB1Q13480 694 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SQSTM1Q13501 440 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SPHARQ15513 63 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NIPAL3Q6P499 406 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM107Q6UX40 140 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZS52 159 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM210BQ96KR6 192 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC7A7Q9UM01 511 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NRXN2Q9P2S2 1712 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 H3BML4 177 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 HTR1AP08908 422 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FAM87AP0C7U9 286 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NPBWR2P48146 333 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 METAP1P53582 386 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 HERV-K104P63124 156 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 OR10G2Q8NGC3 310 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 MFRPQ9BY79 579 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NAT8Q9UHE5 227 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 USP22Q9UPT9 525 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RAXQ9Y2V3 346 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR51B2Q9Y5P1 312 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TAAR5O14804 337 aa5.69□□□□□ -1.5
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