RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550375.1

BRF1-217, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-217ENST00000550375 HLA-DPB1P04440 258 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 EFNA4P52798 201 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 SLC35A2P78381 396 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 CCL8P80075 99 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 TNK1Q13470 666 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 FOXC2Q99958 501 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 DUSP21Q9H596 190 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 TMEM100Q9NV29 134 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 FRRS1LQ9P0K9 344 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.65□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 MYL12BO14950 172 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 NCR1O76036 304 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 HPXP02790 462 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 CA6P23280 308 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 ACKR3P25106 362 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 Q5PR19 223 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 FDX2Q6P4F2 183 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 RDH10Q8IZV5 341 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 OR52N1Q8NH53 320 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 ELMOD3Q96FG2 381 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 DECR2Q9NUI1 292 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.64□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 A0A1B0GTI1 187 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 A0A1B0GVI7 797 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 MLNRO43193 412 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 RGS10O43665 173 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 IGLV3-1P01715 115 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 DDOSTP39656 456 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 MAP2K3P46734 347 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 OR8B8Q15620 311 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 CARTPTQ16568 116 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 SPRNQ5BIV9 151 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 XAF1Q6GPH4 301 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 DIRC2Q96SL1 478 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 F5H5P2 479 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 LYNX1G3V0Z9 82 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 SYT7O43581 403 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 LALBAP00709 142 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 MT-ND2P03891 347 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 LYNX1P0DP58 116 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 DAOP14920 347 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 TNFSF4P23510 183 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 OR8G1Q15617 311 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 DOK3Q7L591 496 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 ZNF525Q8N782 197 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 ZNF676Q8N7Q3 588 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.62□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 A6NIN4 97 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 CDC14BO60729 498 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 DHRS3O75911 302 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 ADH4P08319 380 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 GNALP38405 381 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 TGM4P49221 684 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 CCR9P51686 369 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 WNT4P56705 351 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 FAM209AQ5JX71 171 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 RNLSQ5VYX0 342 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 PIGCQ92535 297 aa14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
BRF1-217ENST00000550375 MND1Q9BWT6 205 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms