RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 ZNF544Q6NX49 715 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 VHLLQ6RSH7 139 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 SSX8Q7RTT4 187 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 GPR148Q8TDV2 347 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 NOX4Q9NPH5 578 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 HHLA2Q9UM44 414 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 STUB1Q9UNE7 303 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 PLCE1Q9P212 2302 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ZNF879B4DU55 563 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 E7EQL1 145 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 J3QW42 95 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 AIREO43918 545 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 DHRS3O75911 302 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 HLA-DPB1P04440 258 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 CD3EP07766 207 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 UCHL1P09936 223 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 OCM2P0CE71 109 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 GLRXP35754 106 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 FABP6P51161 128 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 VBP1P61758 197 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 PSG7Q13046 419 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 SPCS2Q15005 226 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 Q499Y3 187 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 OR2T2Q6IF00 324 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 SLC22A25Q6T423 547 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 PGAP1Q75T13 922 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 DOK3Q7L591 496 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 RNF144BQ7Z419 303 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 OR5AS1Q8N127 324 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 NUP37Q8NFH4 326 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 FAM222BQ8WU58 562 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 TMEM106AQ96A25 262 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 FGGYQ96C11 551 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ISOC1Q96CN7 298 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 CMBLQ96DG6 245 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 GFI1Q99684 422 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 RGCCQ9H4X1 137 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 NGBQ9NPG2 151 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 DHDHQ9UQ10 334 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ROS1P08922 2347 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 SMIM30A4D0T7 59 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 CD300LBA8K4G0 201 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 H3BMQ9 156 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 CASKO14936 926 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 RAC2P15153 192 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ZNF250P15622 560 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ADRA2CP18825 462 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 COL8A1P27658 744 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 TTKP33981 857 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 RAD52P43351 418 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 MALLQ13021 153 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 TRAM1Q15629 374 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ADIPOQQ15848 244 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 TMEM42Q69YG0 159 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ZNF529Q6P280 563 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms