RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	C10orf35	Q96D05	121 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OR14A2	Q96R54	314 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SLITRK2	Q9H156	845 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	NEK6	Q9HC98	313 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CKLF	Q9UBR5	152 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658		V9GYS6	101 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	PLCE1	Q9P212	2302 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1B0GTI1	187 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC160	A6NGH7	325 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	CD300LB	A8K4G0	201 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF879	B4DU55	563 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658		E7EQL1	145 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	GABRP	O00591	440 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	HS3ST1	O14792	307 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ARL6IP5	O75915	188 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	TFAP2A	P05549	437 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF250	P15622	560 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	FAH	P16930	419 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	KITLG	P21583	273 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ANOS1	P23352	680 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	MYL9	P24844	172 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	SERPINF1	P36955	418 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ALDH3B2	P48448	385 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	PRSS12	P56730	875 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	PPP3R1	P63098	170 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	TLE4	Q04727	773 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	PSG7	Q13046	419 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	MUC15	Q8N387	334 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	PP6455	Q8WZ26	134 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	PIGC	Q92535	297 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	NEUROG1	Q92886	237 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM106A	Q96A25	262 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	SLC22A4	Q9H015	551 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ABCB9	Q9NP78	766 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	FLNC	Q14315	2725 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	DSCAM	O60469	2012 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658		B9A039	149 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658		M0R233	179 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	MAGEB3	O15480	346 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	AIRE	O43918	545 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV3-13	P01766	116 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	BMP4	P12644	408 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	GAL	P22466	123 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	GADD45A	P24522	165 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	TGFBR2	P37173	567 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	EVX1	P49640	407 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	FABP5	Q01469	135 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	BLMH	Q13867	455 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	GPR107	Q5VW38	600 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	SATL1	Q86VE3	508 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	OR8G5	Q8NG78	346 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	OR8S1	Q8NH09	359 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	PHYHIP	Q92561	330 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	FGGY	Q96C11	551 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	YIPF6	Q96EC8	236 aa		10.19	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms