RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532872.5

RPS3-218, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-218ENST00000532872 GRPP07492 148 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 GRK5P34947 590 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 TIGD6Q17RP2 521 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 ZNF826PQ6ZT77 177 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 SLC16A9Q7RTY1 509 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 DPY19L4Q7Z388 723 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 GCSAMQ8N6F7 178 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 OR52H1Q8NGJ2 320 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 OR8S1Q8NH09 359 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 BCAS4Q8TDM0 211 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 GIPC3Q8TF64 312 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 RNF133Q8WVZ7 376 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 REEP6Q96HR9 211 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 FEVQ99581 238 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 ABHD6Q9BV23 337 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 KIF17Q9P2E2 1029 aa10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
RPS3-218ENST00000532872 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 FAM183AA6NL82 134 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 ZNF879B4DU55 563 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 GLCEO94923 617 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 CST1P01037 141 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 LHBP01229 141 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 PAICSP22234 425 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 CFL1P23528 166 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 GSTT1P30711 240 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 CFHR2P36980 270 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 IL13RA1P78552 427 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 FAM3AP98173 230 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 C11orf91Q3C1V1 193 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 C16orf87Q6PH81 154 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 SHFQ7M4L6 423 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 PRSS45Q7RTY3 260 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 IQCF1Q8N6M8 205 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 OTULINQ96BN8 352 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 SGK3Q96BR1 496 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 PCGF1Q9BSM1 259 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 CHID1Q9BWS9 393 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 C1orf21Q9H246 121 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 PRDM13Q9H4Q3 707 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 MED20Q9H944 212 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 MARCH7Q9H992 704 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa10.64□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 P2RY10O00398 339 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 TMPRSS2O15393 492 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 TIPRLO75663 272 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 TOX4O94842 621 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 GYPAP02724 150 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 T-ENOLP0DO92 83 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 MMP9P14780 707 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 OPRL1P41146 370 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 DEFB112Q30KQ8 113 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 FAM57BQ71RH2 274 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 FAM90A1Q86YD7 464 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 TIGD4Q8IY51 512 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 ADGRG5Q8IZF4 528 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 FTMTQ8N4E7 242 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 OR10A2Q9H208 303 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 OR51V1Q9H2C8 321 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 RGCCQ9H4X1 137 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 SMURF1Q9HCE7 757 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 NOX4Q9NPH5 578 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 KAAG1Q9UBP8 84 aa10.63□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 POM121CA8CG34 1229 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 SRRM5B3KS81 715 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 GNGT2O14610 69 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 DVL1O14640 695 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 ACOT8O14734 319 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 ECDO95905 644 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 SFTPBP07988 381 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 H2BFMP0C1H6 154 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 POU1F1P28069 291 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 GNALP38405 381 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 GSK3AP49840 483 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 SNCBQ16143 134 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 MICBQ29980 383 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 GFOD2Q3B7J2 385 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 PRR31Q5SQ13 230 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 METTL11BQ5VVY1 283 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 WDR86Q86TI4 376 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 C11orf53Q8IXP5 236 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 OR1M1Q8NGA1 313 aa10.62□□□□□ -0.71
RPS3-218ENST00000532872 LRRC29Q8WV35 223 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms