RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 J3QRE1 110 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 IFNL4K9M1U5 179 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 WNT9BO14905 357 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PNPP00491 289 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 DBTP11182 482 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 GATA4P43694 442 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF85Q03923 595 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF91Q05481 1191 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SNCBQ16143 134 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF684Q5T5D7 378 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC23Q5W5X9 447 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CYB5R2Q6BCY4 276 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 KLBQ86Z14 1044 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 YIPF7Q8N8F6 280 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 APH1BQ8WW43 257 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CYGBQ8WWM9 190 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SIGLEC11Q96RL6 698 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 NPTNQ9Y639 398 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SULT1C4O75897 302 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 IGLV3-1P01715 115 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 IL5RAQ01344 420 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF691Q5VV52 312 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 FTMTQ8N4E7 242 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 DHRSXQ8N5I4 330 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SPERTQ8NA61 448 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 LGALS12Q96DT0 336 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SOX7Q9BT81 388 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 G6PC2Q9NQR9 355 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 METTL15A6NJ78 407 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CLIC3O95833 236 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 TTRP02766 147 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ACKR3P25106 362 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 RBMXP38159 391 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC34A1Q06495 639 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MOGAT3Q86VF5 341 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ITFG2Q969R8 447 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ERGIC1Q969X5 290 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R14AQ96A00 147 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 C1orf159Q96HA4 380 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ADI1Q9BV57 179 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 VCXQ9H320 206 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 YAE1D1Q9NRH1 226 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 OR52A1Q9UKL2 312 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SNX5Q9Y5X3 404 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM178BH3BS89 294 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 WBP4O75554 376 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 RPP14O95059 124 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 IGHV2-70P01814 119 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CDH15P55291 814 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ISL1P61371 349 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MZT1Q08AG7 82 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 BCL2L15Q5TBC7 163 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 LIPNQ5VXI9 398 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 COMMD2Q86X83 199 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ELMOD2Q8IZ81 293 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ACBD7Q8N6N7 88 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SETD9Q8NE22 299 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 OR51E1Q8TCB6 317 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 Q8TCH9 128 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 AMBNQ9NP70 447 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR84Q9NQS5 396 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 C2CD3Q4AC94 2353 aa16.02■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 DAPL1A0PJW8 107 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 ISPDA4D126 451 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 INAFM1C9JVW0 142 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 H0YAE9 185 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 CST4P01036 141 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP6V1B1P15313 513 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 GNALP38405 381 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 PMELP40967 661 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP2K3P46734 347 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 LMO4P61968 165 aa16.01■□□□□ 0.15
PACSIN3-208ENST00000531226 BTG1P62324 171 aa16.01■□□□□ 0.15
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