RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528252.5

SOX6-210, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SOX6, Length 2,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-210ENST00000528252 HSPB2A8KAH6 182 aa7.29□□□□□ -1.24
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SOX6-210ENST00000528252 IGHG1P01857 330 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 ZNF35P13682 527 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 ADRA2CP18825 462 aa7.29□□□□□ -1.24
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SOX6-210ENST00000528252 CLDN12P56749 244 aa7.29□□□□□ -1.24
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SOX6-210ENST00000528252 SLC35A1P78382 337 aa7.29□□□□□ -1.24
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SOX6-210ENST00000528252 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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SOX6-210ENST00000528252 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.29□□□□□ -1.24
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SOX6-210ENST00000528252 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 CENPMQ9NSP4 180 aa7.29□□□□□ -1.24
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SOX6-210ENST00000528252 RCE1Q9Y256 329 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.29□□□□□ -1.24
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SOX6-210ENST00000528252 IFITM5A6NNB3 132 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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SOX6-210ENST00000528252 HACD4Q5VWC8 232 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 ST7LQ8TDW4 575 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 SLITRK2Q9H156 845 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 V9GY05 133 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 ZNF726A6NNF4 738 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 HMSDA8MTL9 139 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 ZNF432O94892 652 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 MAS1P04201 325 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 ZNF44P15621 663 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 CDAP32320 146 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 GDNFP39905 211 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 CYB561P49447 251 aa7.28□□□□□ -1.24
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SOX6-210ENST00000528252 H3F3AP84243 136 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 PCK2Q16822 640 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 MOB3CQ70IA8 216 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 OR6X1Q8NH79 312 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 MFFQ9GZY8 342 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 IL17BQ9UHF5 180 aa7.28□□□□□ -1.24
SOX6-210ENST00000528252 OPN4Q9UHM6 478 aa7.28□□□□□ -1.24
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