RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACKR3	P25106	362 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD80	P33681	288 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDOST	P39656	456 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMB10	P40306	273 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	GSK3A	P49840	483 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASSF2	P50749	326 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	ESRRG	P62508	458 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR8B8	Q15620	311 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIGD6	Q17RP2	521 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	ESCO2	Q56NI9	601 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	C12orf73	Q69YU5	71 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	THEM6	Q8WUY1	208 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	OCEL1	Q9H607	264 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRD7	Q9NPI1	651 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF7	Q9UBF6	113 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	MIOX	Q9UGB7	285 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	COPS3	Q9UNS2	423 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRP12	Q9Y561	859 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP4S1	Q9Y587	144 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0A6YYJ9	748 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014		G3V2T6	193 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOC1	P02654	83 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	EGR1	P18146	543 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAS	P25445	335 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIPN	Q5VXI9	398 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP43	Q70EL4	1123 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPERT	Q8NA61	448 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	NANP	Q8TBE9	248 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC6A7	Q99884	636 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR10A2	Q9H208	303 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	ESM1	Q9NQ30	184 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT84	Q9NSB2	600 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM206A	Q9NX38	181 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	C22orf46	C9J442	243 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	LGALS8	O00214	317 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMD9	O00233	223 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV3-1	P01715	115 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRP	P07492	148 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRF2	P14316	349 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	HILS1	P60008	231 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSNK2B	P67870	215 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT74	Q7RTS7	529 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEX29	Q8N6K0	151 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGAM5	Q96HS1	289 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	CIB1	Q99828	191 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	SP140L	Q9H930	580 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	AUP1	Q9Y679	476 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	PITPNB	P48739	271 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNB2	P62879	340 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ROM1	Q03395	351 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		10.57	□□□□□ -0.72

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