RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 KAZALD1Q96I82 304 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 GABRG3Q99928 467 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 MLST8Q9BVC4 326 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 HES7Q9BYE0 225 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CHST5Q9GZS9 411 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM126AQ9H061 195 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.24□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 FAM159BA6NKW6 160 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 COPEO14579 308 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CXCL13O43927 109 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CDC14BO60729 498 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 RDH16O75452 317 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CLIC3O95833 236 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 RENP00797 406 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 APOA2P02652 100 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 C8GP07360 202 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 OR5AL1P0C617 328 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 FMO3P31513 532 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 TFPI2P48307 235 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 GSK3BP49841 420 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 PPP3R1P63098 170 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 PPP1R1AQ13522 171 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CDK10Q15131 360 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 DCST2Q5T1A1 773 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 Q6ZWC4 215 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 COMMD7Q86VX2 200 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 MDS2Q8NDY4 140 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 OR4X1Q8NH49 305 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 IL17FQ96PD4 163 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 OR7D2Q96RA2 312 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 FOXC2Q99958 501 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 AGMATQ9BSE5 352 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PP64 1363 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 A0A087WUJ7 227 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1B0GW55 424 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 HSD17B6O14756 317 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 STC2O76061 302 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 PTTG1O95997 202 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CD8AP01732 235 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CRYGDP07320 174 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 OR56A5P0C7T3 313 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 MED14OSP0DP75 135 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 COX5AP20674 150 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 FPR3P25089 353 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 OR1E2P47887 323 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 PTH2RP49190 550 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 RORCP51449 518 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 ERVFRD-1P60508 538 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 BAXQ07812 192 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 OR5I1Q13606 314 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CDSNQ15517 529 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 CYS1Q717R9 158 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.22□□□□□ -1.41
PDCD4-211ENST00000498367 PGBD5Q8N414 524 aa6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms