RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 OR10Z1Q8NGY1 313 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 BAALCQ8WXS3 180 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM243Q9BU79 118 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 TM6SF2Q9BZW4 377 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf198Q9H425 327 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 UNC13AQ9UPW8 1703 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-212ENST00000491302 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 S100A9P06702 114 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ADRA2AP08913 450 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 GGT2P36268 569 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 EIF1P41567 113 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP12-2P59991 146 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 CYP24A1Q07973 514 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 EBI3Q14213 229 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00483Q53H64 154 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 AP1ARQ63HQ0 302 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 MDP1Q86V88 176 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 RNF157Q96PX1 679 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 DOCK9Q9BZ29 2069 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0B4J2E0 115 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 RSPH10B2B2RC85 870 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 FOXH1O75593 365 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 UPK1BO75841 260 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 GLSO94925 669 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV3-11P04433 115 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 RHOXF2BP0C7M4 288 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 RSPH10BP0C881 870 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 CD70P32970 193 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF684Q5T5D7 378 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A25Q6KCM7 469 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 CD300LGQ6UXG3 332 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 SLC30A8Q8IWU4 369 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 DAW1Q8N136 415 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 OR4A15Q8NGL6 344 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 OR1J4Q8NGS1 313 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 OR8D1Q8WZ84 308 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 FRZBQ92765 325 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 RDH12Q96NR8 316 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 EMC6Q9BV81 110 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ENOPH1Q9UHY7 261 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHA8P1O95397 391 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 PAHP00439 452 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 OPRK1P41145 380 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 CXCL12P48061 93 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R31P59538 309 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 PAFAH1B2P68402 229 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 NAB1Q13506 487 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1FQ16864 119 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf47Q569G3 176 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 SAXO2Q658L1 398 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 LGI3Q8N145 548 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 RBBP8Q99708 897 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 H0YJW9 148 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 DFFAO00273 331 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 TTC4O95801 387 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 GCGP01275 180 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV2D-28P01615 120 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-11P01762 117 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 THRAP10827 490 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R60P59551 318 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35B1P78383 322 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ST3GAL4Q11206 333 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 OR1Q1Q15612 314 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ASCL4Q6XD76 172 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 OR52P1PQ8NH57 321 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 TBL1YQ9BQ87 522 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 XKR8Q9H6D3 395 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF442Q9H7R0 627 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO8Q9NRD0 319 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 RHBDL2Q9NX52 303 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 GGA2Q9UJY4 613 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 RFNGQ9Y644 331 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 BICRAQ9NZM4 1560 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF11O15085 1522 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 TPM1P09493 284 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF32P17041 273 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-212ENST00000491302 APLNRP35414 380 aa4.67□□□□□ -1.66
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