RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470268.1

SF3B1-208, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, human

TSL 2

Gene SF3B1, Length 2,003 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3B1-208	ENST00000470268	LIPN	Q5VXI9	398 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	OR8B4	Q96RC9	309 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	MGLL	Q99685	303 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	C1orf198	Q9H425	327 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	OR6C6	A6NF89	314 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268		J3QLW9	94 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	SGCE	O43556	437 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	AIRE	O43918	545 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	DOK2	O60496	412 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	TMCC2	O75069	709 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	CLDN14	O95500	239 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF19	P17023	458 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	AGA	P20933	346 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	CRYGS	P22914	178 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	IL32	P24001	234 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	TTK	P33981	857 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	PSMB10	P40306	273 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	BMX	P51813	675 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ACTC1	P68032	377 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ACTA1	P68133	377 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	MNT	Q99583	582 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ATF6B	Q99941	703 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF878	C9JN71	531 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268		F5H5K5	113 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SF3B1-208	ENST00000470268	CLPX	O76031	633 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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