RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 KRT77Q7Z794 578 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PLPP7Q8NBV4 271 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 OR11L1Q8NGX0 322 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 FAHD2AQ96GK7 314 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF319Q9P2F9 582 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PPIAL4EA0A075B759 164 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 CEACAM18A8MTB9 384 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PPIAL4DF5H284 164 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 J3QLI3 93 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF205O95201 554 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PPIAL4FP0DN26 164 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 CPT2P23786 658 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 GSK3AP49840 483 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ROM1Q03395 351 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 OR8B8Q15620 311 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 MPPED2Q15777 294 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 GFOD2Q3B7J2 385 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 DCAF12L2Q5VW00 463 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 GID4Q8IVV7 300 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 OR8B12Q8NGG6 310 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 IL4I1Q96RQ9 567 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PKP2Q99959 881 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 MROQ9BYG7 248 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 RIBC2Q9H4K1 309 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 FN3KRPQ9HA64 309 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM165Q9HC07 324 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 HAO2Q9NYQ3 351 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 COPS3Q9UNS2 423 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 A8MXK9 166 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF254O75437 659 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 DCTDP32321 178 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 SNCBQ16143 134 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF404Q494X3 552 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ESCO2Q56NI9 601 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM201AQ5SY85 155 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF679Q8IYX0 411 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 FTMTQ8N4E7 242 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 TEX29Q8N6K0 151 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 OR8S1Q8NH09 359 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 OR8B4Q96RC9 309 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 MNTQ99583 582 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 C14orf119Q9NWQ9 140 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF7Q9UBF6 113 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF391Q9UJN7 358 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PPIAL4AQ9Y536 164 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ACOD1A6NK06 481 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PRR32B1ATL7 298 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PSMD9O00233 223 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 PHYHO14832 338 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 AVPP01185 164 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ALPLP05186 524 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 WNT2P09544 360 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS2P15880 293 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 RFLNBQ8N5W9 214 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 OR8J1Q8NGP2 316 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 LYZL4Q96KX0 146 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM246Q9BRR3 403 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM206AQ9NX38 181 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 MIOXQ9UGB7 285 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 METRNQ9UJH8 293 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 IKZF2Q9UKS7 526 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 ORC6Q9Y5N6 252 aa11.84□□□□□ -0.51
SH3BP4-205ENST00000444916 LOC105371242A0A075B767 164 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A0U1RQV5 110 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 A6NLC8 198 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 EI24O14681 340 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 GRPP07492 148 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 ACKR3P25106 362 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 HTR1FP30939 366 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 GNALP38405 381 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-205ENST00000444916 RIDAP52758 137 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms