RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SCN3BQ9NY72 215 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 STARD10Q9Y365 291 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 AUP1Q9Y679 476 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 CCDC182A6NF36 153 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 SNTNA6NMZ2 147 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 APOL3O95236 402 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 SLC2A5P22732 501 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 SLC25A30Q5SVS4 291 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 CMBLQ96DG6 245 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 MAP6Q96JE9 813 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 MSL2Q9HCI7 577 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 OPN4Q9UHM6 478 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 ATPIF1Q9UII2 106 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-210ENST00000442481 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-210ENST00000442481 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.832e-39■■■■■ 28.3
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PRAME-210ENST00000442481 M0R135 149 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-210ENST00000442481 CXCR4P61073 352 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-210ENST00000442481 HIST1H3AP68431 136 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-210ENST00000442481 PSG7Q13046 419 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-210ENST00000442481 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-210ENST00000442481 SGCDQ92629 289 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 SLAMF6Q96DU3 332 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 RNFT2Q96EX2 444 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 ZNF799Q96GE5 643 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 INTS14Q96SY0 518 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-210ENST00000442481 GLCEO94923 617 aa9.82□□□□□ -0.84
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PRAME-210ENST00000442481 ATP6V1E1P36543 226 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 MMP15P51511 669 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 PRKXP51817 358 aa9.82□□□□□ -0.84
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PRAME-210ENST00000442481 GABARAPL2P60520 117 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 MALLQ13021 153 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 ZNF154Q13106 437 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 TMEM155Q4W5P6 130 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 SLC35D3Q5M8T2 416 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 OR2T2Q6IF00 324 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.82□□□□□ -0.84
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