RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GATA4P43694 442 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GSK3AP49840 483 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ALDH3A2P51648 485 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM3AP98173 230 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 POU4F2Q12837 409 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAB21L1Q13394 359 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZMYND11Q15326 602 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCNJ8Q15842 424 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ESCO2Q56NI9 601 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AADACL4Q5VUY2 407 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DCAF12L2Q5VW00 463 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC35F2Q8IXU6 374 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF679Q8IYX0 411 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLPP7Q8NBV4 271 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR4M2Q8NGB6 313 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR51G2Q8NGK0 314 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 S100A14Q9HCY8 104 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCB9Q9NP78 766 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPIAL4AQ9Y536 164 aa10.46□□□□□ -0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C5orf63A6NC05 138 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNTNA6NMZ2 147 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H3BNX3 289 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF205O95201 554 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PNPP00491 289 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ALPLP05186 524 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPS2P15880 293 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GATA3P23771 443 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CPT2P23786 658 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HTR1FP30939 366 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DCTDP32321 178 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CXCR4P61073 352 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LCN2P80188 198 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NLRC3Q7RTR2 1065 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRSS45Q7RTY3 260 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CBR4Q8N4T8 237 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EME1Q96AY2 570 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR8B4Q96RC9 309 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SIGLEC11Q96RL6 698 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MICU1Q9BPX6 476 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TTTY10Q9BZA0 68 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIM36Q9NQ86 728 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLN6Q9NWW5 311 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HAO2Q9NYQ3 351 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 USE1Q9NZ43 259 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RNF7Q9UBF6 113 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MIOXQ9UGB7 285 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WNK2Q9Y3S1 2297 aa10.45□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 J3QLI3 93 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM20BO75063 409 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRT8P05787 483 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAP2K3P46734 347 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EFNB1P98172 346 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IL5RAQ01344 420 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ROM1Q03395 351 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EGR3Q06889 387 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMED1Q13445 227 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MPPED2Q15777 294 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 THAP5Q7Z6K1 395 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR10H4Q8NGA5 316 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR8B12Q8NGG6 310 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 Q8TCH9 128 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ITFG2Q969R8 447 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADGRL4Q9HBW9 690 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C1orf123Q9NWV4 160 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR5V1Q9UGF6 321 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 METRNQ9UJH8 293 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MPC1Q9Y5U8 109 aa10.44□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A0U1RQV5 110 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CEACAM18A8MTB9 384 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR2T7P0C7T2 308 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANOS1P23352 680 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GNB2P62879 340 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR8B8Q15620 311 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BCL2L15Q5TBC7 163 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MEDAGQ5VYS4 303 aa10.43□□□□□ -0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCTD8Q6ZWB6 473 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms