RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 PDCD1Q15116 288 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 OLFML2AQ68BL7 652 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 TIGD4Q8IY51 512 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 TMEM86BQ8N661 226 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 KIR3DL3Q8N743 410 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 OR51L1Q8NGJ5 315 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 OR11L1Q8NGX0 322 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 LRTOMTQ8WZ04 291 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 PRDM13Q9H4Q3 707 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 TMEM100Q9NV29 134 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-204ENST00000403441 TVP23AA6NH52 213 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 FAM183AA6NL82 134 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 G3V2T6 193 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 H0YL77 283 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 TIMM23O14925 209 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 MLNRO43193 412 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 HMGN1P05114 100 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 ZNF823P16415 610 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 RPS27P42677 84 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 GATA4P43694 442 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 RPL15P61313 204 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 KCNJ8Q15842 424 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 CD276Q5ZPR3 534 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 Q6YL49 198 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 ZNF511Q8NB15 262 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 SSMEM1Q8WWF3 244 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 ERGIC1Q969X5 290 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 TECTBQ96PL2 329 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 PCGF1Q9BSM1 259 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 CDADC1Q9BWV3 514 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 CHIAQ9BZP6 476 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 MMP27Q9H306 513 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 MED20Q9H944 212 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 POMT1Q9Y6A1 747 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 DOCK11Q5JSL3 2073 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 CLPSL1A2RUU4 121 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 ZAR1LA6NP61 321 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 E9PQ18 207 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 EBAG9O00559 213 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 CIB2O75838 187 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 HLA-DQA2P01906 255 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 HLA-DPB1P04440 258 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 ANOS1P23352 680 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 EPHA2P29317 976 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 NPY4RP50391 375 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 MALLQ13021 153 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 SLC35D3Q5M8T2 416 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 FAM201AQ5SY85 155 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 SLX4IPQ5VYV7 408 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 TMEM236Q5W0B7 351 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 DCXRQ7Z4W1 244 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 Q8TCH9 128 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 RNF133Q8WVZ7 376 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 GATAD2BQ8WXI9 593 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 UBE2FQ969M7 185 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 PITX2Q99697 317 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 CITED1Q99966 193 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 OSBPL10Q9BXB5 764 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 C1RLQ9NZP8 487 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 WNK1Q9H4A3 2382 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 C22orf46C9J442 243 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 ZNF878C9JN71 531 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 M0R135 149 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 P2RY10O00398 339 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 FAM20BO75063 409 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 TOX4O94842 621 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 LIPFP07098 398 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 SFTPBP07988 381 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 MELTFP08582 738 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 PAICSP22234 425 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 POU1F1P28069 291 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 GSTT1P30711 240 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 CFHR2P36980 270 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 RAD23AP54725 363 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 C12orf73Q69YU5 71 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 PLBD1Q6P4A8 553 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 DRAM2Q6UX65 266 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 LYPD2Q6UXB3 125 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 PRSS45Q7RTY3 260 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 AMIGO2Q86SJ2 522 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-204ENST00000403441 NAA40Q86UY6 237 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms