RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384530.1

RNU6-35P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 35, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-35P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-35P-201ENST00000384530 SPP1P10451 314 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 RALAP11233 206 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ERGP11308 486 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 RNH1P13489 461 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 HSD3B1P14060 373 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZNF3P17036 446 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 CYP11B2P19099 503 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 CYP3A5P20815 502 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 FPR3P25089 353 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 SERPINB3P29508 390 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 SLC1A1P43005 524 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 GDI2P50395 445 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 PRKAA2P54646 552 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 PKNOX1P55347 436 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 TCL1AP56279 114 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 TIMM10P62072 90 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 GRB2P62993 217 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 HBA1P69905 142 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 BTG2P78543 158 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZBED6P86452 979 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZNF543Q08ER8 600 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 GPR68Q15743 365 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZBTB6Q15916 424 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 DECR1Q16698 335 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 RFX4Q33E94 735 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZNF718Q3SXZ3 478 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ACSM3Q53FZ2 586 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 MESTQ5EB52 335 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 XKR3Q5GH77 459 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 C10orf91Q5T1B1 145 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 LRIF1Q5T3J3 769 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 OR5M10Q6IEU7 315 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 LRRC8BQ6P9F7 803 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 Q6ZVL8 140 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 SCD5Q86SK9 330 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 SAMD3Q8N6K7 520 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 SLC37A3Q8NCC5 494 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 LINS1Q8NG48 757 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 OR52L2PQ8NGH6 319 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 OR6X1Q8NH79 312 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 NDNFQ8TB73 568 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 CRYGNQ8WXF5 182 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 OSTF1Q92882 214 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 MVB12AQ96EY5 273 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 EEF2KMTQ96G04 330 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 APIPQ96GX9 242 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 POM121L2Q96KW2 1035 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 TSNARE1Q96NA8 513 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 RNF5Q99942 180 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ADI1Q9BV57 179 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 RAB34Q9BZG1 259 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 DRC3Q9H069 523 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 GLT8D2Q9H1C3 349 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 C2orf40Q9H1Z8 148 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 OR10A5Q9H207 317 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ABCG5Q9H222 651 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 LRRC19Q9H756 370 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 SPACA1Q9HBV2 294 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 GALNT9Q9HCQ5 603 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 LINC00474Q9P2X8 69 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZNF180Q9UJW8 692 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 HHLA2Q9UM44 414 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ASF1AQ9Y294 204 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 A0A1W2PQ09 198 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 hDV102S1A0JD36 115 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ODAMA1E959 279 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 OR2M5A3KFT3 312 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 A8MUU9 505 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 EFCAB8A8MWE9 144 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 SULT2B1O00204 365 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 TP53I11O14683 189 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 TNFSF11O14788 317 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 TSPAN4O14817 238 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-35P-201ENST00000384530 ACOX3O15254 700 aa-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.9 ms