RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCB9Q9NP78 766 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 AASSQ9UDR5 926 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ZANQ9Y493 2812 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFHX3Q15911 3703 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR32B1ATL7 298 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 CA6P23280 308 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP2K3P46734 347 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PRSS12P56730 875 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTA2P62736 377 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTG2P63267 376 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SSX6Q7RTT6 188 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10AD1Q8NGE0 317 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ITLN1Q8WWA0 313 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ERGIC1Q969X5 290 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MEGF10Q96KG7 1140 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SIGLEC11Q96RL6 698 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 AMBNQ9NP70 447 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 C14orf119Q9NWQ9 140 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF319Q9P2F9 582 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 GNG8Q9UK08 70 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 OR52A1Q9UKL2 312 aa13.04□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SONP18583 2426 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC30A6NM36 301 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 F5H5P2 479 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 J3QRE1 110 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MLNRO43193 412 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 LILRA1O75019 489 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 RPP14O95059 124 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 CLIC3O95833 236 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 HLA-DPB1P04440 258 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF85Q03923 595 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 OR8B8Q15620 311 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF684Q5T5D7 378 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 LIPNQ5VXI9 398 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC9AQ6UXN8 241 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ELMOD2Q8IZ81 293 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PLPP7Q8NBV4 271 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 OR8S1Q8NH09 359 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 APH1BQ8WW43 257 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 HPS1Q92902 700 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM106BQ9NUM4 274 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MPC1Q9Y5U8 109 aa13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A096LNT2 108 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ANXA2P2A6NMY6 339 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 H0YL77 283 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 WBP4O75554 376 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 ANOS1P23352 680 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CD200P41217 278 aa13.02□□□□□ -0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 ISL1P61371 349 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MED21Q13503 144 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 GALEQ14376 348 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM249Q2WGJ8 235 aa13.02□□□□□ -0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 THAP5Q7Z6K1 395 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf87Q8N0U7 546 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC54Q8NEL0 328 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 OR11L1Q8NGX0 322 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CNIH3Q8TBE1 160 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51E1Q8TCB6 317 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TFAP2CQ92754 450 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR84Q9NQS5 396 aa13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM20BO75063 409 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CST4P01036 141 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHA1P01876 353 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TTRP02766 147 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 IRF2P14316 349 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 DCKP27707 260 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPA13P48723 471 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TP53I3Q53FA7 332 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 SYS1Q8N2H4 156 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 OR52I1Q8NGK6 324 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 NRG4Q8WWG1 115 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 LYZL4Q96KX0 146 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MICU1Q9BPX6 476 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ALG8Q9BVK2 526 aa13.01□□□□□ -0.33
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