RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 GINS3Q9BRX5 216 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.27□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 SERTM1A2A2V5 107 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 SLC25A1P53007 311 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 FAM109AQ8N4B1 249 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 DOCK1Q14185 1865 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 SLC17A2O00624 439 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 PI3P19957 117 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 MSRB3Q8IXL7 192 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 ORAI1Q96D31 301 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 DDOQ99489 341 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 NTN4Q9HB63 628 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 LAMP3Q9UQV4 416 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 LRP12Q9Y561 859 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 BCORQ6W2J9 1755 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 SPRY3O43610 288 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 ANGPTL7O43827 346 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 RAB35Q15286 201 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 HMGN3Q15651 99 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 NUBPLQ8TB37 319 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 GPR87Q9BY21 358 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 GNB4Q9HAV0 340 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 SERPINE3A8MV23 424 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 CD3DP04234 171 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 EPXP11678 715 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 FAM27D1Q5T7N8 215 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 DEGS2Q6QHC5 323 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 OR10D3Q8NH80 312 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 SARGQ9BW04 601 aa9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 HLA-HP01893 362 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 CCL4P13236 92 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 ATF1P18846 271 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 FUT3P21217 361 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 GNB1P62873 340 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 CBLN3Q6UW01 205 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 GPR32P1Q8NGA4 272 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 C20orf141Q9NUB4 165 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 A0A0B4J203 849 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 FMODQ06828 376 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 C12orf73Q69YU5 71 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 YIPF5Q969M3 257 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 GALMQ96C23 342 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 DERL3Q96Q80 235 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 GNG13Q9P2W3 67 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 ASPDHA6ND91 283 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 EPPINO95925 133 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 GIPP09681 153 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 HRH1P35367 487 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 Q6ZNX1 250 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 OR13G1Q8NGZ3 307 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 GPX8Q8TED1 209 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 TCFL5Q9UL49 500 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 DLL1O00548 723 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 JTBO76095 146 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 OR10J4P0C629 311 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 PSMB6P28072 239 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF83P51522 516 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 ZIC1Q15915 447 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 Q8IYB0 196 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 PXT1Q8NFP0 134 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 PTDSS2Q9BVG9 487 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 TUBG2Q9NRH3 451 aa9.25□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 ZFP92A6NM28 416 aa9.24□□□□□ -0.93
ZNF548-202ENST00000366197 NDUFB3O43676 98 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms