RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ABCG5Q9H222 651 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM38AQ9H6F2 299 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 METTL7AQ9H8H3 244 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF302Q9NR11 478 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 PARP11Q9NR21 331 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLN6Q9NWW5 311 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC39A1Q9NY26 324 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 LTBP2Q14767 1821 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 CACNA1GO43497 2377 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 C15orf65H3BRN8 121 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLDN34H7C241 214 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 AP3B1O00203 1094 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 SERPINB7O75635 380 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR2J3O76001 311 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 HBE1P02100 147 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 USF1P22415 310 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRKACBP22694 351 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR1E1P30953 314 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 PPICP45877 212 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ACOT2P49753 483 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 FABP6P51161 128 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 HADHQ16836 314 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 WDR59Q6PJI9 974 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 OPN5Q6U736 354 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 DRAM1Q8N682 238 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF645Q8N7E2 425 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 SNX31Q8N9S9 440 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 LRRC75AQ8NAA5 344 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR9G4Q8NGQ1 327 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 LYPD6BQ8NI32 183 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 DCAKDQ8WVC6 231 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 GHSRQ92847 366 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 RASD2Q96D21 266 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 C18orf15Q96N68 181 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPR21Q99679 349 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 CENPKQ9BS16 269 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 SFXN3Q9BWM7 321 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZYG11BQ9C0D3 744 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 PIGUQ9H490 435 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 DUSP21Q9H596 190 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 INIPQ9NRY2 104 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 RGS18Q9NS28 235 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 TREX1Q9NSU2 369 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ASF1BQ9NVP2 202 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 TAS2R5Q9NYW4 299 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ASB3Q9Y575 518 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 SAR1BQ9Y6B6 198 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 JCADQ9P266 1359 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 MYO9BQ13459 2157 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 BAHCC1Q9P281 2608 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ISPDA4D126 451 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 E7EQL1 145 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 PSPHP1O15172 72 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 NMT2O60551 498 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC16A7O60669 478 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 HUS1O60921 280 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 WBP4O75554 376 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 LSM8O95777 96 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGHG2P01859 326 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRT14P02533 472 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 PGA5P0DJD9 388 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 CD28P10747 220 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 CTRB1P17538 263 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRSS3P35030 304 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 APLNRP35414 380 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 NDUFA8P51970 172 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR12D2P58182 307 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 SELENBP1Q13228 472 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 CEP55Q53EZ4 464 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMPPEQ6ZT21 453 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 SCD5Q86SK9 330 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM228AQ86W67 206 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 HORMAD1Q86X24 394 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPRMLQ8N4K4 120 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPR26Q8NDV2 337 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 SFXN5Q8TD22 340 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 FBXO32Q969P5 355 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 C8orf44Q96CB5 159 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ECHDC3Q96DC8 303 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 SMARCD1Q96GM5 515 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR2V2Q96R30 315 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 CALN1Q9BXU9 219 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 DYRK4Q9NR20 520 aa0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms