RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAV2P51636 162 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NEK2P51955 445 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRYQ05066 204 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GOLGA8FQ08AF8 430 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR8G1Q15617 311 aa-4.49□□□□□ -3.13
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 FXNQ16595 210 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MMEL1Q495T6 779 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SV2CQ496J9 727 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C10orf76Q5T2E6 689 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RINT1Q6NUQ1 792 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AADACL2Q6P093 401 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C2orf82Q6UX34 121 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HEPN1Q6WQI6 88 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPTE2Q6XPS3 522 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAB11FIP2Q7L804 512 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP-4.49□□□□□ -3.13
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 PACRGLQ8N7B6 248 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR4K17Q8NGC6 315 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR11H4Q8NGC9 324 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR11L1Q8NGX0 322 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC13A3Q8WWT9 602 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ST8SIA1Q92185 356 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RFKQ969G6 155 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VPS50Q96JG6 964 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OSBPL9Q96SU4 736 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIGD2AQ9BW72 106 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUCNR1Q9BXA5 334 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BCL2L14Q9BZR8 327 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAOK3Q9H2K8 898 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C11orf1Q9H5F2 150 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HELLSQ9NRZ9 838 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIF1ANQ9NWT6 349 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANAPC5Q9UJX4 755 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PILRBQ9UKJ0 227 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC7A7Q9UM01 511 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP-4.49□□□□□ -3.13
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 POLR1DQ9Y2S0 133 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTC41PQ6P2S7 1318 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLB1Q6P1J6 1458 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa-4.5□□□□□ -3.13
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 SHTN1A0MZ66 631 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRORSD1PA6NEY8 169 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM150CB9EJG8 249 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 F8VP50 259 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 J3QQQ9 107 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SGK494L7N484 410 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 XKRYO14609 159 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STAU1O95793 577 aaKnown RBP-4.5□□□□□ -3.13
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV3-33P01772 117 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCCBP05166 539 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SFTA3P0C7M3 94 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HK1P19367 917 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPN6P29350 595 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAPGP40121 348 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP-4.5□□□□□ -3.13
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR3A1P47881 315 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP-4.5□□□□□ -3.13
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 PKNOX1P55347 436 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TCL1AP56279 114 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPL26P61254 145 aaKnown RBP-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AP2B1P63010 937 aa-4.5□□□□□ -3.13
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDKL1Q00532 357 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF91Q05481 1191 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GOLGA2Q08379 1002 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR33Q49SQ1 333 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DDI2Q5TDH0 399 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CEP57L1Q8IYX8 460 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DTWD1Q8N5C7 304 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM239Q8WW34 195 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM143Q96AN5 459 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COG8Q96MW5 612 aa-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP-4.5□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC35A5Q9BS91 424 aa-4.5□□□□□ -3.13
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