RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 MSGN1A6NI15 193 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 FOLR2P14207 255 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 ADRA2CP18825 462 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 CD200P41217 278 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SLC7A9P82251 487 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 METTL12A8MUP2 240 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 PGA4P0DJD7 388 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 PGA5P0DJD9 388 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 ADH5P11766 374 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 HTR3DQ70Z44 454 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 IL22RA2Q969J5 263 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 TRGC1P0CF51 173 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 DUSP1P28562 367 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 CLRN1P58418 232 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 NR0B2Q15466 257 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 RNF128Q8TEB7 428 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 ARID2Q68CP9 1835 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 GREM1O60565 184 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SLC2A1P11166 492 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 MCEMP1Q8IX19 187 aa14.92□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 A0A0B4J2E0 115 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 A0A1B0GX12 115 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 M0QZK8 103 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 OR4C5Q8NGB2 326 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 NXPE3Q969Y0 559 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SERPINA7P05543 415 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 PGCP20142 388 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 AGAP20933 346 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 HTR5AP47898 357 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 RAB38P57729 211 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 EXTL1Q92935 676 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 CHST11Q9NPF2 352 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 KLK13Q9UKR3 277 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SIAH2O43255 324 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 KLK2P20151 261 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 FPR2P25090 351 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 VAMP8Q9BV40 100 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.91□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 CST7O76096 145 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SOD2P04179 222 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SFTPCP11686 197 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 CD79AP11912 226 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SELLP14151 372 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 LAG3P18627 525 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 FUT5Q11128 374 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 DHCR24Q15392 516 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 LPAR4Q99677 370 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 E9PQ18 207 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 FGF16O43320 207 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 STARD6P59095 220 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 ERVS71-1P61550 626 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 TOMM20Q15388 145 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 ADOQ96SZ5 270 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 B9D1Q9UPM9 204 aa14.9□□□□□ -0.02
PACS1-201ENST00000320580 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.4 ms