RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 SOX7Q9BT81 388 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 MND1Q9BWT6 205 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM36Q9NQ86 728 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 BABAM2Q9NXR7 383 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM64A6NGJ6 449 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 OR4C45A6NMZ5 311 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 DHRS7CA6NNS2 312 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 LILRA1O75019 489 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 DHRS3O75911 302 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 LALBAP00709 142 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 MT-ND2P03891 347 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ISG15P05161 165 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ACKR3P25106 362 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 PTH2RP49190 550 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF81P51508 661 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CDK5R1Q15078 307 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 PCGF3Q3KNV8 242 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 XAF1Q6GPH4 301 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 Q6ZR03 302 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 DOK3Q7L591 496 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 KLBQ86Z14 1044 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 OR5AS1Q8N127 324 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 BHLHE23Q8NDY6 225 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 GATAD2BQ8WXI9 593 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 SORCS2Q96PQ0 1159 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 DIRC2Q96SL1 478 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 SLC22A4Q9H015 551 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 MSL2Q9HCI7 577 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM212A6NML5 194 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 P2RY10O00398 339 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OGG1O15527 345 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV1-46P01743 117 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CD55P08174 381 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 RPSAP08865 295 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MAP2K3P46734 347 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TAS2R43P59537 309 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 BDH1Q02338 343 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ACSM1Q08AH1 577 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 KCTD21Q4G0X4 260 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 FAM209AQ5JX71 171 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 COMMD2Q86X83 199 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 FTMTQ8N4E7 242 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR14K1Q8NGZ2 314 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR13G1Q8NGZ3 307 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TPK1Q9H3S4 243 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM100Q9NV29 134 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 V9GYS6 101 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CSMD1Q96PZ7 3565 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 DYSFO75923 2080 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1B0GVI7 797 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MLNRO43193 412 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SYT7O43581 403 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFS7O75251 213 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZFPL1O95159 310 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV4-39P01824 125 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF12P17014 697 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ACHEP22303 614 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 EFNA4P52798 201 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ATP5J2P56134 94 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 DOC2BQ14184 412 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SPHARQ15513 63 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ODF4Q2M2E3 257 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SMIM19Q96E16 107 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 FOXC2Q99958 501 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC90BQ9GZT6 254 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MYO9AB2RTY4 2548 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SPRY3O43610 288 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 GMDSO60547 372 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 F12P00748 615 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms