RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.06
KCNQ1-201ENST00000155840 OR5B2Q96R09 309 aa15.39■□□□□ 0.06
KCNQ1-201ENST00000155840 CLCC1Q96S66 551 aa15.39■□□□□ 0.06
KCNQ1-201ENST00000155840 SPSB2Q99619 263 aa15.39■□□□□ 0.06
KCNQ1-201ENST00000155840 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.39■□□□□ 0.06
KCNQ1-201ENST00000155840 MED9Q9NWA0 146 aa15.39■□□□□ 0.06
KCNQ1-201ENST00000155840 RAB22AQ9UL26 194 aa15.39■□□□□ 0.06
KCNQ1-201ENST00000155840 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa15.39■□□□□ 0.06
KCNQ1-201ENST00000155840 LTBP2Q14767 1821 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 ISXQ2M1V0 245 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 DNM1P46Q6ZS02 220 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 OR1L3Q8NH93 324 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 PMM1Q92871 262 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF407Q9C0G0 2248 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 E9PLN8 166 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 PHYHO14832 338 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 CD8AP01732 235 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 SFTA3P0C7M3 94 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 CPT2P23786 658 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 EMC4Q5J8M3 183 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 OR5H2Q8NGV7 314 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 ST7LQ8TDW4 575 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 VN1R1Q9GZP7 353 aa15.39■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 F2RL1P55085 397 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 CLRN1P58418 232 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF813Q6ZN06 617 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM59Q9BXS4 323 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 ESPL1Q14674 2120 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 CACNA1EQ15878 2313 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 STMND1H3BQB6 276 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 GDF9O60383 454 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 OR8U9P0C7N5 309 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 CRABP1P29762 137 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM76BQ5HYJ3 339 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 RTL10Q7L3V2 364 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 RAB11FIP2Q7L804 512 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 C6orf201Q7Z4U5 140 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC43A2Q8N370 569 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 APCDD1LQ8NCL9 501 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 OR5D14Q8NGL3 314 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 OR10S1Q8NGN2 331 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 OR8U1Q8NH10 309 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 CD300LFQ8TDQ1 290 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 AQP3Q92482 292 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 FANCFQ9NPI8 374 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF814B7Z6K7 855 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 SGCEO43556 437 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM50BP56557 158 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 MEF2DQ14814 521 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM244Q5VVB8 128 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF141Q8WVD5 230 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM230Q96A57 120 aa15.38■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 PNLIPP16233 465 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 FAHP16930 419 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 PEA15Q15121 130 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 TOMM20Q15388 145 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC22A24Q8N4F4 322 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 TERB2Q8NHR7 220 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A1W2PPE3 182 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A1W2PR64 198 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A1W2PRV1 198 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 C5orf67F2Z3F1 127 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 S100A6P06703 90 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 DBHP09172 617 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 PTGFRP43088 359 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 YPEL5P62699 121 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 SUMF1Q8NBK3 374 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM86C1Q9NVL1 165 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 HNF4GQ14541 408 aa15.36■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAM5Q6NVV9 412 aa15.36■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 Q6ZRG5 221 aa15.36■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 IP6K3Q96PC2 410 aa15.36■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 LPAR5Q9H1C0 372 aa15.36■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 TAF9BQ9HBM6 251 aa15.36■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 OBP2AQ9NY56 170 aa15.36■□□□□ 0.05
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAV20A0A0B4J274 112 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms