RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, human

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLN3-255	ENST00000637100	ARF6	P62330	175 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	CDON	Q4KMG0	1287 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	DRAM2	Q6UX65	266 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	OR4K13	Q8NH42	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	LHX4	Q969G2	390 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	PKP2	Q99959	881 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CLN3-255	ENST00000637100	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	NCK1	P16333	377 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	FANK1	Q8TC84	345 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	SPTSSA	Q969W0	71 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	OPA3	Q9H6K4	179 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	CD300A	Q9UGN4	299 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100		A0A1B0GVI7	797 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	GPR37	O15354	613 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	OR10H3	O60404	316 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	TSPAN15	O95858	294 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	DDOST	P39656	456 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	TGM4	P49221	684 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	SMIM11A	P58511	58 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	OR8B8	Q15620	311 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	FAM162A	Q96A26	154 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	SASH3	O75995	380 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	DIRAS1	O95057	198 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	GYPA	P02724	150 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	PSKH1	P11801	424 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	AMY2B	P19961	511 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	TEX30	Q5JUR7	227 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	GLYAT	Q6IB77	296 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	WDR86	Q86TI4	376 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	OR52J3	Q8NH60	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	TNFRSF14	Q92956	283 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	UBE2F	Q969M7	185 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	BHLHE40	O14503	412 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	FBP1	P09467	338 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	TGFBR2	P37173	567 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	TSPAN31	Q12999	210 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	FBLN7	Q53RD9	439 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100		Q8N7P7	452 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	KCNJ15	Q99712	375 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	FN3K	Q9H479	309 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	XRCC2	O43543	280 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	GADD45G	O95257	159 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	HMGA2	P52926	109 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	WDR82	Q6UXN9	313 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	FGFRL1	Q8N441	504 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	PYURF	Q96I23	114 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CLN3-255	ENST00000637100	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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