RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586963.1

CAPNS1-203, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CAPNS1, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-203ENST00000586963 CTSZQ9UBR2 303 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-203ENST00000586963 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-203ENST00000586963 RNF114Q9Y508 228 aa6.65□□□□□ -1.34
CAPNS1-203ENST00000586963 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.65□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 OOEPA6NGQ2 149 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 M0R135 149 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ARPC2O15144 300 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ADAM20O43506 726 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 GPR137BO60478 399 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 CA6P23280 308 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC6A6P31641 620 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 PRSS12P56730 875 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 PROK1P58294 105 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SMIM11AP58511 58 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 KRTAP10-3P60369 221 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 MZT1Q08AG7 82 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 TAF9Q16594 264 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 LINC01006Q8NI28 216 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 FANK1Q8TC84 345 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SPTSSAQ969W0 71 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF799Q96GE5 643 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 PYURFQ96I23 114 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 MAP6Q96JE9 813 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SIRPDQ9H106 197 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 OR52D1Q9H346 318 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 V9GYQ6 96 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 OR6C68A6NDL8 312 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 GGT3PA6NGU5 568 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 C3orf80F5H4A9 247 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 DIRAS1O95057 198 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 GADD45GO95257 159 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 LHBP01229 141 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 HLA-DQA2P01906 255 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF823P16415 610 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ATP6V1B2P21281 511 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 NOS3P29474 1203 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 DDOSTP39656 456 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 IER3P46695 156 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ARF6P62330 175 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 MS4A2Q01362 244 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ZNF92Q03936 586 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 OR8B8Q15620 311 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SPATS1Q496A3 300 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 DRAM2Q6UX65 266 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 OR4K13Q8NH42 304 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 OR52J3Q8NH60 311 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 LHX4Q969G2 390 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 IFT27Q9BW83 186 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 C1orf21Q9H246 121 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 C16orf95Q9H693 158 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 OPA3Q9H6K4 179 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 KPTNQ9Y664 436 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 A0A0U1RQK1 487 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 A0A1B0GVI7 797 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 BHLHE40O14503 412 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 DVL1O14640 695 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 GPR37O15354 613 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 OR10H3O60404 316 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 FCN3O75636 299 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 IGHV4-59P01825 116 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 GYPAP02724 150 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 SEMG1P04279 462 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 GRPP07492 148 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-203ENST00000586963 IFNGR2P38484 337 aa6.62□□□□□ -1.35
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