RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 TP53I3Q53FA7 332 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 LHFPL3Q86UP9 236 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 DIRC2Q96SL1 478 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALG8Q9BVK2 526 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKAP9Q99996 3911 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD300LBA8K4G0 201 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSX4O60224 188 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADH4P08319 380 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 EGFL6Q8IUX8 553 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIGLEC11Q96RL6 698 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF649Q9BS31 505 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACOXLQ9NUZ1 547 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX5Q9Y5X3 404 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0U1RQV5 110 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 GGT3PA6NGU5 568 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPRY3O43610 288 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 LY6HO94772 140 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV1-46P01743 117 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM3AP98173 230 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM209AQ5JX71 171 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZR03 302 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHNO1Q9BSD3 238 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASSF4Q9H2L5 321 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 G6PC2Q9NQR9 355 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS13CQ709C8 3753 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 EFCAB10A6NFE3 127 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 XPNPEP2O43895 674 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIPP12273 146 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDOSTP39656 456 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEB1P43366 347 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR12D2P58182 307 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSNK2BP67870 215 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNCBQ16143 134 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 C6orf141Q5SZD1 244 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 RORBQ92753 470 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 GGHQ92820 318 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC30A2Q9BRI3 323 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52A1Q9UKL2 312 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCL2L15Q5TBC7 163 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYS1Q8N2H4 156 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR56B2PQ8NGI1 322 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR13G1Q8NGZ3 307 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 C4orf36Q96KX1 117 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 LILRA1O75019 489 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCL8P80075 99 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM80Q96HE8 168 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITPR3Q14573 2671 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 J3QLW9 94 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTRP02766 147 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 LIMS3P0CW19 117 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 LIMS4P0CW20 117 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF19P17023 458 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSK3AP49840 483 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSTQ16762 297 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC12BQ2HXU8 276 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPNS3Q6ZMD2 512 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELMOD2Q8IZ81 293 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF525Q8N782 197 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 WFDC11Q8NEX6 87 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2Z1Q8NG97 314 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYZL4Q96KX0 146 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 DECR2Q9NUI1 292 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM100Q9NV29 134 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCR1O76036 304 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV3-1P01715 115 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 HPXP02790 462 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD55P08174 381 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAOP14920 347 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST3GAL4Q11206 333 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8B8Q15620 311 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNM1P46Q6ZS02 220 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CATSPERDQ86XM0 798 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R14AQ96A00 147 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELMOD3Q96FG2 381 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GWJ7 208 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC1A7O00341 560 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSF3P09919 207 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYL12AP19105 171 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFSF4P23510 183 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC2AQ6UVW9 174 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 AHSA2Q719I0 299 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51E1Q8TCB6 317 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITFG2Q969R8 447 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNBD2Q96M20 576 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC22A4Q9H015 551 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAP30LQ9HAJ7 183 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 DSCR9P59020 149 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNK1Q13470 666 aa28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms