RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572205.5

SMG6-210, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 4

Gene SMG6, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-210ENST00000572205 LYZL4Q96KX0 146 aa7.31□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 OR2V2Q96R30 315 aa7.31□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 KCNJ15Q99712 375 aa7.31□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.31□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 GCM1Q9NP62 436 aa7.31□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.31□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.31□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 FAM206AQ9NX38 181 aa7.31□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.31□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.31□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 VSTM5A8MXK1 200 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 F5H5P2 479 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 J3QRE1 110 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 HLA-DPB1P04440 258 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 HMGN1P05114 100 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZNF823P16415 610 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 LIPAP38571 399 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 CD200P41217 278 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 CX3CR1P49238 355 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 PRKXP51817 358 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 CHN2P52757 468 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 BLVRAP53004 296 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 TMEM33P57088 247 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ISL1P61371 349 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 FAM3AP98173 230 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ROM1Q03395 351 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZMYND11Q15326 602 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ARL9Q6T311 187 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 Q8TCH9 128 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 COG8Q96MW5 612 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 DIRC2Q96SL1 478 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 TEAD3Q99594 435 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 SLC29A1Q99808 456 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 COPS4Q9BT78 406 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 TREM2Q9NZC2 230 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 IL19Q9UHD0 177 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 LRP12Q9Y561 859 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 PLSCR5A0PG75 271 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 CD300LBA8K4G0 201 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 A8MXK9 166 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 TMPRSS2O15393 492 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 PNPP00491 289 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 FSHBP01225 129 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 MT-ND5P03915 603 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 LCATP04180 440 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 LYNP07948 512 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 GZMKP49863 264 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 TPTEP56180 551 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 PAX2Q02962 417 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 MPPED2Q15777 294 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 SNAPC1Q16533 368 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 Q6ZSR3 168 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 UBE2FQ969M7 185 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 SPTSSAQ969W0 71 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 SGK3Q96BR1 496 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 OR8B4Q96RC9 309 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZNF649Q9BS31 505 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 TOR3AQ9H497 397 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-210ENST00000572205 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms