RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 OR2V2Q96R30 315 aa16.11■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 RGCCQ9H4X1 137 aa16.11■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 IKZF2Q9UKS7 526 aa16.11■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CLDN25C9JDP6 229 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 H0YL77 283 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 PPIHO43447 177 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 MPZL2O60487 215 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ENTPD6O75354 484 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 APOL3O95236 402 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 OR2T7P0C7T2 308 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CFL1P23528 166 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CHN2P52757 468 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 RIDAP52758 137 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM3AP98173 230 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 EGR3Q06889 387 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 Q71RC1 249 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 OR56B2PQ8NGI1 322 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 OR2T27Q8NH04 317 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC22A4Q9H015 551 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 DCLRE1BQ9H816 532 aa16.1■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ACOD1A6NK06 481 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CD5LO43866 347 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 HLA-DPB1P04440 258 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP6V1E1P36543 226 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 DDOSTP39656 456 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 MTNR1AP48039 350 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC3A1Q07837 685 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 SSX6Q7RTT6 188 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 OR8B12Q8NGG6 310 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 CCL17Q92583 94 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 MEGF10Q96KG7 1140 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 TBX5Q99593 518 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM206AQ9NX38 181 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 TREM2Q9NZC2 230 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 AASSQ9UDR5 926 aa16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 HIVEP2P31629 2446 aa16.08■□□□□ 0.17
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 LRP5LA4QPB2 252 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SNTNA6NMZ2 147 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 F5H5P2 479 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 IGHV4-31P0DP07 118 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SRP9P49458 86 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 GFOD2Q3B7J2 385 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 APOL4Q9BPW4 351 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF391Q9UJN7 358 aa16.08■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CA6P23280 308 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 GZMKP49863 264 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MMP16P51512 607 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 OR8G1Q15617 311 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 OR8B8Q15620 311 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 RHOXF1Q8NHV9 184 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 HPS1Q92902 700 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 RNFT2Q96EX2 444 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 TIMD4Q96H15 378 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM106BQ9NUM4 274 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 DOCK11Q5JSL3 2073 aa16.07■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A0U1RQV5 110 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 GMDSO60547 372 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT8P05787 483 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 IL2RGP31785 369 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CD200P41217 278 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 GSK3AP49840 483 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ACTC1P68032 377 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ACTA1P68133 377 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MVKQ03426 396 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MAB21L1Q13394 359 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 AVPI1Q5T686 147 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 CLDND2Q8NHS1 167 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 RAB1CQ92928 201 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 LYZL4Q96KX0 146 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 Q96MT0 163 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 PBOV1Q9GZY1 135 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 NARFLQ9H6Q4 476 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 MOB1AQ9H8S9 216 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 GCM1Q9NP62 436 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 DCAF16Q9NXF7 216 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 R4GMQ9 66 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 FN1P02751 2386 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-208ENST00000531226 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa16.05■□□□□ 0.16
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