RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 ZMYND11Q15326 602 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 LCN1P1Q5VSP4 162 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC16A9Q7RTY1 509 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 SGK3Q96BR1 496 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 YIPF3Q9GZM5 350 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 G6PC2Q9NQR9 355 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 MXRA5Q9NR99 2828 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 ALOX5APP20292 161 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 CFL1P23528 166 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 EPHA2P29317 976 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 SRP14P37108 136 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 EFNB1P98172 346 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 TIGD6Q17RP2 521 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 C12orf73Q69YU5 71 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM57BQ71RH2 274 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 KLBQ86Z14 1044 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 C1orf87Q8N0U7 546 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 OR56B2PQ8NGI1 322 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 FAHD2AQ96GK7 314 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 REEP6Q96HR9 211 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 OR10A2Q9H208 303 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 LAMP5Q9UJQ1 280 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 OAZ3Q9UMX2 235 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC182A6NF36 153 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 EBAG9O00559 213 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM3AP98173 230 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 SPERTQ8NA61 448 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 Q8TCH9 128 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 PYDC1Q8WXC3 89 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 MDFIQ99750 246 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 CIB1Q99828 191 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 OSBPL10Q9BXB5 764 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 NIPAL2Q9H841 368 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 COL6A5A8TX70 2615 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 A0A0G2JMP0 313 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 A0A0X1KG70 313 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 FSTL3O95633 263 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 PNPP00491 289 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 IRF2P14316 349 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 PMELP40967 661 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 TCEANCQ8N8B7 351 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 PLPP7Q8NBV4 271 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 OR4M2Q8NGB6 313 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM163Q8TC26 289 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 PGAM5Q96HS1 289 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 RGCCQ9H4X1 137 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 BRD7Q9NPI1 651 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4-217ENST00000527644 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 FOXH1O75593 365 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 CPT2P23786 658 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 HCCSP53701 268 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 NXNL2Q5VZ03 156 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 DEGS2Q6QHC5 323 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 LRRN1Q6UXK5 716 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 KRT77Q7Z794 578 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 OR11L1Q8NGX0 322 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM165Q9HC07 324 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF319Q9P2F9 582 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 GATA3P23771 443 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 LCN2P80188 198 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 MZT1Q08AG7 82 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 AADACL4Q5VUY2 407 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 ZFP1Q6P2D0 407 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 TEX29Q8N6K0 151 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 FN3KRPQ9HA64 309 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 LRP12Q9Y561 859 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 PPIAL4EA0A075B759 164 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 SAC3D1A6NKF1 404 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC22A31A6NKX4 558 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 F5H0A9 414 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 PPIAL4DF5H284 164 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 J3QLI3 93 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 M0R129 80 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 PPIAL4FP0DN26 164 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 GSK3AP49840 483 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 MPPED2Q15777 294 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-217ENST00000527644 DCAF12L2Q5VW00 463 aa22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms