RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 LPCAT3Q6P1A2 487 aa9.02□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 FAM60AQ9NP50 221 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H2BKO60814 126 aa9.02□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H2BJP06899 126 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H2BOP23527 126 aa9.02□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H2BBP33778 126 aa9.02□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 TMED7Q9Y3B3 224 aa9.02□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 IGHEP01854 428 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZRG5 221 aa9.01□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A36Q96CQ1 311 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 PRR13Q9NZ81 148 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 UPB1Q9UBR1 384 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 WIF1Q9Y5W5 379 aa9.01□□□□□ -0.97
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