RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516462.1

RNU6-1110P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1110, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1110P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1110P-201ENST00000516462 PIGUQ9H490 435 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 AUNIPQ9H7T9 357 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 LINC00574Q9H8X3 128 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CRLF2Q9HC73 371 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 MED4Q9NPJ6 270 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RGS18Q9NS28 235 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 FAM49BQ9NUQ9 324 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TMEM100Q9NV29 134 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CLN6Q9NWW5 311 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CLN8Q9UBY8 286 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 DDX19BQ9UMR2 479 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 KCNE3Q9Y6H6 103 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SCN2AQ99250 2005 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 PTPRTO14522 1441 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TSPOAP1O95153 1857 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 MUC19Q7Z5P9 8384 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 NEURL4Q96JN8 1562 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 A0A0A6YYD5 115 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 LRRIQ4A6NIV6 560 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ZNF233A6NK53 670 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 BTNL10A8MVZ5 291 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 C16orf90A8MZG2 172 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ANKRD65E5RJM6 399 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 M0R1X1 148 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RRP8O43159 456 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SLC16A7O60669 478 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CTNSO60931 367 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 MPDU1O75352 247 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RBBP9O75884 186 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SLC22A5O76082 557 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SEMA3DO95025 777 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CDRT1O95170 752 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RCBTB2O95199 551 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 HPRT1P00492 218 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 IGKV1-39P01597 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 IGKV1-17P01599 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 IGKV1D-16P01601 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TRBV12-3P01733 135 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 HLA-HP01893 362 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 IGKV1D-39P04432 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 STAG3L3P0CL85 134 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SRMP19623 302 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 PRKACBP22694 351 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ME2P23368 584 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CD82P27701 267 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CFHR2P36980 270 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TALDO1P37837 337 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 PPICP45877 212 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 GPR1P46091 355 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 PRLHRP49683 370 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 GDI2P50395 445 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 BCAP31P51572 246 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CLDN8P56748 225 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RBX1P62877 108 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RAD51Q06609 339 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ZNF33AQ06730 810 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 GTF3C1Q12789 2109 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ART3Q13508 389 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 PNOCQ13519 176 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 IL18Q14116 193 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 FAM53BQ14153 422 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 KIR2DS1Q14954 304 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 C16orf72Q14CZ0 275 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 QPRTQ15274 297 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 PRSS8Q16651 343 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CCL15Q16663 113 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 PGGHGQ32M88 737 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SP6Q3SY56 376 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 COX19Q49B96 90 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 C6orf99Q4VX62 202 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 LUZP6Q538Z0 58 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 KLHL12Q53G59 568 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TCEAL5Q5H9L2 206 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TEX30Q5JUR7 227 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 STUMQ69YW2 141 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TBPL2Q6SJ96 375 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 OPN5Q6U736 354 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 EPGNQ6UW88 154 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ASCL4Q6XD76 172 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SSX9Q7RTT3 188 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ZNF547Q8IVP9 402 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 MYOCDQ8IZQ8 938 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CMTM8Q8IZV2 173 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1110P-201ENST00000516462 JAGN1Q8N5M9 183 aa0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms