RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505583.5

GYPB-205, Transcript of glycophorin B (MNS blood group), human

TSL 1 (best)

Gene GYPB, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYPB-205	ENST00000505583	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583		A0A1B0GUS0	222 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	LGALS8	O00214	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	P2RY10	O00398	339 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	DVL1	O14640	695 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	RGS13	O14921	159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	ADAM20	O43506	726 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	OR10H3	O60404	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	CLPX	O76031	633 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	GYPA	P02724	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	CRYBA1	P05813	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	IRF2	P14316	349 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	AMY2B	P19961	511 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	IFNA8	P32881	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	IER3	P46695	156 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	SLC7A2	P52569	658 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	BPIFB3	P59826	476 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	DGCR6	Q14129	220 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	OR8G1	Q15617	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	RFX4	Q33E94	735 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583		Q6ZSV7	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	PNKD	Q8N490	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	DYRK2	Q92630	601 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	PITX2	Q99697	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	ATF6B	Q99941	703 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	GID8	Q9NWU2	228 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583		A0A1W2PRD5	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583		A0A1W2PRF3	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583		A0A1W2PRM7	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	MEGF11	A6BM72	1044 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583		M0QZ24	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583		M0R135	149 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	ARPC3	O15145	178 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	GSTA4	O15217	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	LHB	P01229	141 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	TFF1	P04155	84 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	GRP	P07492	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	SLC2A1	P11166	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	COX4I1	P13073	169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	SELL	P14151	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	RHCE	P18577	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	CRABP1	P29762	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	PYCR1	P32322	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	NPY4R	P50391	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	PDCD1	Q15116	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	OR8B8	Q15620	311 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	LNX2	Q8N448	690 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GYPB-205	ENST00000505583	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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