RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 ALKBH6Q3KRA9 238 aa12.4□□□□□ -0.42
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SH3BP2-208ENST00000504294 OR52A1Q9UKL2 312 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa12.37□□□□□ -0.43
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SH3BP2-208ENST00000504294 PSMD9O00233 223 aa12.36□□□□□ -0.43
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