RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 APMAPQ9HDC9 416 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PLA2G3Q9NZ20 509 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ABI3Q9P2A4 366 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF222Q9UK12 451 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SHROOM3Q8TF72 1996 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 XIRP2A4UGR9 3374 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5H15A6NDH6 313 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 OOEPA6NGQ2 149 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5H1A6NKK0 313 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR1O75083 606 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SCRG1O75711 98 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ACTL6BO94805 426 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 S1PR2O95136 353 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 MT-ND1P03886 318 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 CELA3AP09093 270 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 UGT2B7P16662 529 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ADCYAP1P18509 176 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 MPZP25189 248 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 FOLR3P41439 243 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 AKR1C2P52895 323 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 GEMP55040 296 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFA6P56556 154 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TIRAPP58753 221 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 FBLN7Q53RD9 439 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 H3F3CQ6NXT2 135 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM219AQ8IW50 185 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 OR14L1PQ8NHC6 308 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 CCL4L1Q8NHW4 92 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SCAMP4Q969E2 229 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 COQ8BQ96D53 544 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC35G5Q96KT7 338 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 HRASLS2Q9NWW9 162 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 JPT1Q9UK76 154 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PILRAQ9UKJ1 303 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 LRP12Q9Y561 859 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 EFCAB9A8MZ26 197 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 NPIPA5E9PKD4 350 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 NPIPA3F8WFD2 350 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 LDB2O43679 373 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SCGNO76038 276 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 GLSO94925 669 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 CLDN7O95471 211 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 GZMBP10144 247 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF28P17035 718 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 AZU1P20160 251 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TGFBR1P36897 503 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC6A8P48029 635 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SOX2P48431 317 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 GAS1P54826 345 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ERVK11-1P61568 191 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PAX5Q02548 391 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PAX2Q02962 417 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ACVR1Q04771 509 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 IL10RAQ13651 578 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 KEAP1Q14145 624 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM198Q66K66 360 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 STEAP4Q687X5 459 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2A2Q6IF42 318 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRTM1Q86UE6 522 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 AQP12AQ8IXF9 295 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 CDRT4Q8N9R6 151 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 GATSQ8NAP1 163 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 B3GNT7Q8NFL0 401 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC26A10Q8NG04 563 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 OR13C4Q8NGS5 318 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ST8SIA1Q92185 356 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SYT11Q9BT88 431 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 DAPP1Q9UN19 280 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 NPIPA1Q9UND3 350 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ST3GAL6Q9Y274 331 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPRBP23467 1997 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A087WUJ7 227 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 A8MVM7 634 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 E7EQ34 232 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 G3V3Y1 287 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 OR7C2O60412 319 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFB8O95169 186 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms