RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 SPDEFO95238 335 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NTN1O95631 604 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NUDT14O95848 222 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PPBPP02775 128 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 P04436 131 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CPEP16870 476 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CXCR1P25024 350 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ADH6P28332 368 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CYB561P49447 251 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CDC42P60953 191 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TLE4Q04727 773 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXC1Q12948 553 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MADCAM1Q13477 382 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CLINT1Q14677 625 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 C22orf42Q6IC83 251 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 VASH2Q86V25 355 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 BEST3Q8N1M1 668 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TERB2Q8NHR7 220 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PFN4Q8NHR9 129 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CORO2AQ92828 525 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 S100A13Q99584 98 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GPA33Q99795 319 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CLN6Q9NWW5 311 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KLK13Q9UKR3 277 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MPDZO75970 2070 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0D9SG52 128 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 AHRRA9YTQ3 701 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BN98 237 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 H7C417 338 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MASP2O00187 686 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF208O43345 1280 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CYTIPO60759 359 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM127O75204 238 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HPXP02790 462 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL3P10147 92 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MAKP20794 623 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MAS1LP35410 378 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR4P46093 362 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CDK5Q00535 292 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC10A1Q14973 349 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR6V1Q8N148 313 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GALNT16Q8N428 558 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FGF11Q92914 225 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 BOD1Q96IK1 185 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CLCC1Q96S66 551 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 JAM3Q9BX67 310 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PROK2Q9HC23 129 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DKK4Q9UBT3 224 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 A8MVM7 634 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OGG1O15527 345 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LANCL1O43813 399 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CDC14BO60729 498 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A12O75746 678 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MT-ATP6P00846 226 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PMP2P02689 132 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 BDKRB2P30411 391 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 AP3S2P59780 193 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MFAP5Q13361 173 aa6.43□□□□□ -1.38
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