RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 MISPQ8IVT2 679 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FTMTQ8N4E7 242 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR52N5Q8NH56 324 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ASB10Q8WXI3 467 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DDIT4LQ96D03 193 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 HAVCR1Q96D42 359 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RASL10BQ96S79 203 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MFRPQ9BY79 579 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TTC28Q96AY4 2481 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 DBX1A6NMT0 343 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GABARAPH6UMI1 98 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 P2RY10O00398 339 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ABCD4O14678 606 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RGS11O94810 467 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SMIM6P0DI80 62 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CDAP32320 146 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 Q8NA96 180 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 POM121Q96HA1 1249 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CHIAQ9BZP6 476 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 EMC7Q9NPA0 242 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GWJ7 208 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 LIPT2A6NK58 231 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GPR37O15354 613 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CLN5O75503 358 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ZNF432O94892 652 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SIX6O95475 246 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MPC2O95563 127 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CD2P06729 351 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 H2BFMP0C1H6 154 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 CALCBP10092 127 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SLC2A1P11166 492 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 DNASE1L1P49184 302 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PRKXP51817 358 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MFAP5Q13361 173 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GSG1Q2KHT4 349 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 TMEM225Q6GV28 225 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR8S1Q8NH09 359 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 POC1BQ8TC44 478 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ASB5Q8WWX0 329 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MCHR2Q969V1 340 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 MBP02144 154 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ALDOBP05062 364 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 SPP1P10451 314 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 NDUFB7P17568 137 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 C4BPBP20851 252 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 GNALP38405 381 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PTGDSP41222 190 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 C3P1Q6ZMU1 363 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 BIVMQ86UB2 503 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC4-211ENST00000492996 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.2□□□□□ -1.42
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